EMBC0321p Biochemie I - přednáška

Lékařská fakulta
podzim 2023
Rozsah
3/0/0. 45. 1 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Jana Gregorová, Ph.D. (pomocník)
RNDr. Hana Paulová, CSc. (pomocník)
Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (pomocník)
Mgr. Marie Tomandlová, Ph.D. (pomocník)
Garance
doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D.
Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Rozvrh
Po 30. 10. až Pá 22. 12. Út 10:00–11:50 B22/116 aula, Po 18. 9. až Pá 20. 10. Út 10:00–11:50 B22/116 aula, Čt 9:00–9:50 B22/116 aula; a Út 24. 10. 10:00–11:50 Kinosál N02901
Předpoklady
EMLC0111p Lékařská chemie - přednáška && EMBI0222s Biologie II - seminář || EMBI0222p Biologie II - přednáška
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem předmětu Biochemie I je získat znalosti o základních metabolických pochodech a drahách probíhajících na buněčné úrovni.
Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, které je studováno v navazujícím předmětu Biochemie II.
Výstupy z učení
Po absolvování předmětu bude student schopen:
- porozumět významu základních chemických pojmů a dokáže tuto znalost aplikovat při popisu biochemických procesů v těle a vlastností tělesných tekutin.
- diskutovat vlastnosti a funkci enzymů.
- popsat základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a proteinů a jejich návaznosti.
- rozumět principům získávání, využívání a ukládání energie pochody na buněčné úrovni.
- porozumět funkci buněčných membrán a principu kompartmentace na buněčné úrovni a transportním procesům v membráně.
- znát syntézu proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce, translace a posttranslační úpravy, porozumět vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů.
- znát funkci hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy.
- pochopit principy některých chorob na molekulární úrovni.
Osnova
  • Elektrolyty, aktivita iontů. Slabé kyseliny/báze. Pufry. Bioenergetika, Gibbsova energie, makroergní sloučeniny. Redoxní reakce.
  • Enzymy. Charakteristické rysy biokatalýzy. Kofaktory.
  • Metabolismus živin. Citrátový cyklus. Respirační řetězec. Oxidační fosforylace.
  • Sacharidy. Sacharidy ve výživě. Trávení sacharidů. Základní rysy metabolismu glukosy. Transport glukosy do buněk. Glykolýza. Pyruvátdehydrogenasový komplex. Glukoneogeze.
  • Glykogen. Metabolismus fruktosy, galaktosy, laktosy. Pentosafosfátová dráha. Glykosaminoglykany, proteoglykany.
  • Lipidy a mastné kyseliny. Tenzidy. Lipofilní vitaminy. Lipidy ve výživě. Trávení lipidů. Metabolismus mastných kyselin. Syntéza PUFA. Metabolismus ketolátek.
  • Metabolismus triacylglycerolů, glycerofosfolipidů, sfingolipidů. Lipoperoxidace. Biosyntéza a význam eikosanoidů.
  • Metabolismus cholesterolu, žlučových kyselin. Biosyntéza kalciolů.
  • Aminokyseliny. Peptidy. Struktura proteinů, myosin, kolagen, imunoglobuliny. Hemoglobin, myoglobin. Hemoglobinopatie.
  • Trávení a intracelulární degradace proteinů. Obecné rysy v katabolismu aminokyselin. Metabolismus a toxicita amoniaku.
  • Katabolismus aminokyselin, vrozené poruchy metabolismu aminokyselin. Syntéza neesenciálních aminokyselin.
  • Přeměny aminokyselin na nízkomolekulární produkty. Syntéza hemu, porfyrie.
  • Metabolismus purinových/pyrimidinových nukleotidů.
  • Struktura DNA, RNA. Replikace a opravy. Transkripce a její regulace, posttranskripční úpravy.
  • Syntéza proteinů. Skládání, transport a třídění proteinů v buňce. Posttranslační modifikace.
  • Biosyntéza kolagenu, elastinu.
Literatura
    povinná literatura
  • MURRAY, Robert K., David A. BENDER, Kathleen M. BOTHAM, Peter J. KENNELLY, Victor W. RODWELL a P. Anthony WEIL. Harperova ilustrovaná biochemie. Translated by Bohuslav Matouš. Páté české vydání, prv. Praha: Galén, 2012, xii, 730. ISBN 9788072629077. info
    doporučená literatura
  • LIEBERMAN, Michael a Alisa PEET. Marks' basic medical biochemistry : a clinical approach. Illustrated by Matthew Chansky. 5th edition. Philadelphia: Wolters Kluwer, 2018, xii, 1051. ISBN 9781496387721. info
  • VASUDEVAN, D. M., S. SREEKUMARI a Kannan VAIDYANATHAN. Úvod do všeobecnej a klinicky aplikovanej biochémie. Edited by Jozef Čársky. Prvé slovenské vydanie. Bratislava: Balneotherma s.r.o., 2015, 669 stran. ISBN 9788097015688. info
  • KOOLMAN, Jan a Klaus-Heinrich RÖHM. Barevný atlas biochemie. Grada. Praha, 2012, 498 s. ISBN 978-80-247-2977-0. info
Výukové metody
Přednášky.
Metody hodnocení
Student přechází do pokračující výuky předmětu Biochemie II v dalším semestru bez povinnosti ověření znalosti z předmětu Biochemie I.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2021, podzim 2022, podzim 2024.