PřF:C3210 Strukturní bioinformatika - Course Information
C3210 Strukturní bioinformatika
Faculty of ScienceAutumn 2007 - for the purpose of the accreditation
- Extent and Intensity
- 1/0/0. 1 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Type of Completion: zk (examination).
- Teacher(s)
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc. (lecturer)
- Guaranteed by
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
National Centre for Biomolecular Research – Faculty of Science - Course Enrolment Limitations
- The course is offered to students of any study field.
- Course objectives (in Czech)
- Kurs je zaměřen na získání úvodních znalostí v oblasti strukturní bioinformatiky. Student se nejprve seznámí s rozdílem mezi informací obsaženou explicitně a implicitně v genomu. Dále získá přehled o reprezentaci 3-D struktury molekul v počítači. Bude seznámen se základními strukturními motivy bílkovin a nukleových kyselin, pozná aparát, který umožní 3-D strukturu předpovídat a ujasní si podmíněnost funkce biopolymerů jejich 3-D strukturou. Na závěr se pak obeznámí s možnostmi praktických aplikací výše uvedených postupů a znalostí pro návrhy nových biologicky aktivních molekul.
- Syllabus (in Czech)
- 1.Co je strukturní bioinformatika, definice předmětu. 2.Jak získat 3-D strukturu molekuly a molekulárního systému 3.Základní strukturní motivy v bílkovinách, struktura bílkovin 4.Základní strukturní motivy v nukleových kyselinách, struktura nukleových kyselin 5.Energie jako klíčový fenomén při předpovědi 3-D struktury 6.Molekulová mechanika 7.Řešení konformačního problému, konformační prohledávání 8.Ukládání 3-D dat v databázích, pdb formát 9.Homologní modelování a „threading“ 10.Molekulární komplexy, docking 11.Strukturní bioinformatika a návrhy biologicky aktivních látek 12.Návrhy léků na bázi receptoru a farmakoforu
- Language of instruction
- Czech
- Further Comments
- Course is no more offered.
The course is taught: every week.
- Enrolment Statistics (Autumn 2007 - for the purpose of the accreditation, recent)
- Permalink: https://is.muni.cz/course/sci/autumn2007-forthepurposeoftheaccreditation/C3210