C7920 Struktura a funkce proteinů

Přírodovědecká fakulta
podzim 2022
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
Vyučující
prof. RNDr. Břetislav Brzobohatý, CSc. (přednášející)
Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D. (přednášející)
doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Břetislav Brzobohatý, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
St 17:00–18:50 C03
Předpoklady
Předpokladem pro porozumění předmětu je absolvování základů biochemie nebo molekulární biologie.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
předmět má 9 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Předmět uvádí studenty do problematiky struktury proteinů a dynamického chování proteinů a jejich kombinací ve vztahu k biologickým funkcím proteinů.
Výstupy z učení
Přednáška shrnuje základní poznatky o struktuře a funkci proteinů. V její první části jsou diskutovány strukturní motivy proteinů, jejich stabilita a konformační dynamika. Ve druhé části jsou diskutovány vybrané biologické funkce proteinů (např. enzymy, membránové proteiny, interakce protein-ligand). Ve třetí části jsou uvedeny základní techniky molekulární biologie pro izolaci, klonování genů a expresi proteinů a strukturní biologie pro určování 3D struktur proteinů.
Osnova
  • 1. Základní strukturní principy architektury proteinů. Stavební prvky proteinů. Motivy struktur proteinů. Posttranslační modifikace proteinů. Stabilita a dynamika proteinů.
  • 2. Enzymy a enzymová katalýza. Proteiny interagující s ligandy (např. DNA a RNA molekuly, transkripční a translační faktory). Membránové proteiny, nestrukturované proteiny.
  • 3. Metody přípravy rekombinantních molekul DNA. Izolace a klonování genů. Stanovení sekvence DNA. Produkce rekombinantních proteinů. Předpovídání a modelování struktury proteinů. Biofyzikální metody stanovení 3D struktury proteinů (proteinová krystalografie, kryoelektronová mikroskopie, NMR, SAXS).
Literatura
    doporučená literatura
  • KESSEL, Amit a BEN-TAL Nir. Introduction to proteins. Structure, function and motion. 2nd ed. CRC Press, Taylor and Francis, Boca Raton, Florida USA, 2018, 880 s. ISBN 978-1-4987-4717-2
Výukové metody
přednášky
Metody hodnocení
Ústní zkouška či kolokvium
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, podzim 1999, podzim 2010 - akreditace, podzim 2000, podzim 2001, podzim 2002, podzim 2003, podzim 2004, podzim 2005, podzim 2006, podzim 2007, podzim 2008, podzim 2009, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2023, podzim 2024.