PřF:S1004 Structure of biomolecules - Informace o předmětu
S1004 Methods for structural characterization of biomolecules
Přírodovědecká fakultapodzim 2023
- Rozsah
- 2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
- Vyučující
- Mgr. Josef Houser, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Filip Melicher (přednášející)
MVDr. Eva Paulenová, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D. (přednášející) - Garance
- Mgr. Josef Houser, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta - Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
- Cíle předmětu
- At the end of the course students should be able to:
characterize protein sample for structural studies
understand and explain principles of crystal structure determination of proteins
solve X-ray protein structure
interpret electron density maps, analyze and validate pdb coordinates - Výstupy z učení
- At the end of the course students should be able to:
characterize protein sample for structural studies
understand and explain principles of crystal structure determination of proteins
solve X-ray protein structure
interpret electron density maps, analyze and validate pdb coordinates - Osnova
- 1. Biomolecular sample, characteristics, sample requirements 2. Sample quality analysis – stability, homogeneity 3. Structural methods for analysis of biomolecules, complementarity of techniques 4. Biomacromolecular crystals, crystallization techniques, crystallization experiment 5. Crystal properties, space group and symmetry, assymetric unit 6. Diffraction experiment, diffraciton images processing, methods for phasing, electron density 7. Structural model, density maps, model accuracy, validation, structural databases 8. Optimization of structural experiment 9. Laboratory practicals – characterization of protein sample and crystallization experiments
- Literatura
- doporučená literatura
- PECORA R. Dynamic Light Scattering: Applications of Photon Correlation Spectroscopy, Springer, 1985
- Bergfors, T. M. Protein Crystallization: Second Edition, Oxford University Press, 2009.
- Fundamentals of crystallography. Edited by Carmelo Giacovazzo. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2002, xix, 825 s. ISBN 0-19-850957-X. info
- Circular dichroism and the conformational analysis of biomolecules. Edited by Gerald D. Fasman. New York: Plenum Press, 1996, ix, 738 s. ISBN 0-306-45142-5. info
- Výukové metody
- Intensive course covering lectures and class discussion
- Metody hodnocení
- in-term assessment, final written test
- Vyučovací jazyk
- Angličtina
- Informace učitele
- Course is being taught as a block of lectures, discussions and laboratory exercises at the end of semester - in the examination period.
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Poznámka k četnosti výuky: during exam period, February 7-9, 2017.
- Statistika zápisu (podzim 2023, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2023/S1004