C9095 RNA metabolism

Přírodovědecká fakulta
jaro 2011 - akreditace
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
předmět má 20 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
1. Introduction to the RNA world 2. Gene expression: prokaryotes versus eukaryotes 3. Transcription of mRNAs 4. mRNA processing: 5' end capping, polyadenylation 5. pre-mRNA splicing 6. tRNAs: transcription, processing, translation 7. rRNAs: transcription, processing, localization, ribosome synthesis 8. noncoding RNAs: snRNAs, snoRNAs 9. noncoding RNAs: miRNAs, piRNAs, siRNAs, dsRNAs 10. RNA silencing 11. RNA surveillance and degradation in the nucleus 12. RNA surveillance and degradation in the cytoplasm 13. Methods to study gene expression: microarray analysis, RT-PCR, Northern blot, 3' extension etc. 14. Methods of analysis of RNA conformation and modification
Osnova
  • 1. Introduction to the RNA world 2. Gene expression: prokaryotes versus eukaryotes 3. Transcription of mRNAs 4. mRNA processing: 5' end capping, polyadenylation 5. pre-mRNA splicing 6. tRNAs: transcription, processing, translation 7. rRNAs: transcription, processing, localization, ribosome synthesis 8. noncoding RNAs: snRNAs, snoRNAs 9. noncoding RNAs: miRNAs, piRNAs, siRNAs, dsRNAs 10. RNA silencing 11. RNA surveillance and degradation in the nucleus 12. RNA surveillance and degradation in the cytoplasm 13. Methods to study gene expression: microarray analysis, RT-PCR, Northern blot, 3' extension etc. 14. Methods of analysis of RNA conformation and modification
Literatura
  • The RNA world : the nature of modern RNA suggests a prebiotic RNA world. Edited by Raymond F. Gesteland - John F. Atkins. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1993, xxiii, 630. ISBN 0-87969-456-4. info
Výukové metody
This class is taught in the form of theory lectures. In each lecture, students are asked to solve a task related to the particular theme.
Metody hodnocení
Lectures, discussions during the lectures, literature presentation. Oral examination.
Vyučovací jazyk
Angličtina
Navazující předměty
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý druhý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, podzim 2023.