PřF:Bi7410 Protein Engineering - Course Information
Bi7410 Protein Engineering
Faculty of Sciencespring 2012 - acreditation
The information about the term spring 2012 - acreditation is not made public
- Extent and Intensity
- 1/0. 1 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Type of Completion: zk (examination).
- Teacher(s)
- doc. Mgr. Radka Chaloupková, Ph.D. (lecturer)
Mgr. Eva Šebestová, Ph.D. (lecturer) - Guaranteed by
- prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Department of Experimental Biology – Biology Section – Faculty of Science
Contact Person: doc. Mgr. Radka Chaloupková, Ph.D.
Supplier department: Department of Experimental Biology – Biology Section – Faculty of Science - Course Enrolment Limitations
- The course is offered to students of any study field.
- Course objectives (in Czech)
- Během kurzu získají studenti základní přehled o metodách proteinového inženýrství a biofyzikálních technikách využívaných ke strukturní a funkční charakterizaci nově upravených proteinových variant. Na základě záskaných informací by studenti měli porozumět dvěma základním přístupů proteinového inženýrství, racionálnímu designu a řízené evoluci, a umět rozhodnout za jakých podmínek lze daný přístup proteinového inženýrství použít. Studenti by dále měli získat přehled o bioinformatických nástrojích používaných pro identifikaci nových putativních enzymů v genomových databázích, o izolaci příslušných genů z hostitelských organismů a metodách exprese a purifikace rekombinantních proteinů. Na konci kurzu by studenti měli být schopni rozhodnut jakou metodu použít pro selekci pozitivních enzymových variant s konkrétní vylepšenou vlastností z připravených mutantních knihoven a rovněž vybrat nejvhodnější biofyzikální techniku pro charakterizaci správného strukturního uspořádání, termostability a aktivity enzymů.
- Syllabus (in Czech)
- 1.Proteosyntéza, struktura proteinů, funkce proteinů, strukturně-funkční vztahy
- 2.Identifikace putativních enzymů v genomových databázích - bioinformatická analýza
- 3.Izolace genů z hostitelských organismů, klonování, příprava rekombinantních proteinů, přehled hostitelský organismů, exprese proteinů
- 4. Purifikace proteinů – přehled chromatografických technik
- 5. Strukturní charakterizace proteinů – přehled spektroskopických technik pro analýzu sekundární a terciální struktury proteinů
- 6. Analýza kvarterní struktury proteinů
- 7. Enzymy, enzymová katalýza, faktory ovlivňující rychlost enzymových reakcí
- 8. Aplikační využití enzymů, strategie proteinového inženýrství
- 9. Racionální design – předpověď struktury mutantního enzymů, hodnocení efektu mutace na strukturu a funkci enzymů
- 10. Molekulárně biologické metody proteinového inženýrství
- 11. Řízená evoluce, screening mutantních variant
- 12. Příklady využití proteinového inženýrství pro vylepšení katalytické účinnosti a stability enzymů
- Teaching methods (in Czech)
- Přednášky-teoretická příprava, diskuze aktuálního tématu
- Assessment methods (in Czech)
- Písemná zkouška
- Language of instruction
- Czech
- Further Comments
- The course is taught annually.
The course is taught: every week.
- Enrolment Statistics (spring 2012 - acreditation, recent)
- Permalink: https://is.muni.cz/course/sci/spring2012-acreditation/Bi7410