Je důležité připomenout, že SR není soubor komentářů k jednotlivým odborným textům, ale homogenní výzkum. Studie by měla být členěna podle témat/otázek, a to včetně teoretického ukotvení. Kvalitní SR si také klade další výzkumné otázky a předkládá návrhy ke směřování budoucího výzkumu. Hlavní výhodou metodologicky přesně provedené SR je její vysoká důvěryhodnost a konzistence prezentovaných dat. Ovšem kvalita SR se odvíjí od toho, jak (metodologicky) kvalitní jsou primární studie (data).
Toto hodnocení bývá v zájmu zajištění validity prováděno zpravidla dvěma a více výzkumníky. Klíčové je použití a uvedení standardizovaných nástrojů určených k hodnocení kvality – quality (data) appraisal, přičemž se pro různé druhy primárních studií používají různé nástroje (obr. 9).
Konkrétně jde např. o JBI’s critical appraisal tools, Cochrane Collaboration Risk of Bias Tool (RoB 2) pro randomizované kontrolované studie nebo CASP Checklists.