Průchod studijním plánem
Upozornění:
Studijní plán dobíhá.
FI BIO Bioinformatika a systémová biologie (dobíhající)
Název anglicky: Bioinformatics and systems biology
navazující prezenční se specializací, vyučovací jazyk: čeština![čeština čeština](/pics/flags_svg/cz.svg)
Zahrnut v programu: FI N-UIZD Umělá inteligence a zpracování dat
navazující prezenční se specializací, vyučovací jazyk: čeština
Zahrnut v programu: FI N-UIZD Umělá inteligence a zpracování dat
Informace o studiu
- Součásti SZZ a jejich obsahStátní závěrečná zkouška sestává ze dvou odděleně klasifikovaných součástí: obhajoby diplomové práce a
odborné závěrečné zkoušky. Celá státní zkouška trvá zhruba jednu hodinu (přibližně 30 minut obhajoba, 30 minut zkoušení). Na prezentaci diplomové práce má student 15 minut, dalších 15 minut je věnováno rozboru posudků a diskuzi. V následující ústní závěrečné zkoušce student odpovídá bez přípravy na položené otázky, typicky jde o rozpravu v rozsahu dvou až tří otázek, přičemž minimálně jedna otázka je mu kladena z okruhu společného základu navazujícího studijního programu a minimálně jedna otázka ze studentem vybrané specializace.
Pro úspěšné složení závěrečné zkoušky musí student být schopen vysvětlit základní pojmy s nimiž se seznámil v profilujících předmětech programu, musí demonstrovat schopnost použití základních technik, metod a pojmů vysvětlených v profilujících předmětech programu a musí být schopen reagovat na relevantní doplňující otázky, případně, vybrané téma rozvinout do hloubky. Pokud student není schopen dostát některému z těchto požadavků, je hodnocem stupněm nevyhovující.
Podmínkou přístupu k závěrečné zkoušce je odevzdání diplomové práce. V případě negativních posudků na diplomovou práci se student může vzdát obhajoby, akceptovat hodnocení „nevyhověl“ a přejít rovnou ke zkoušení. V případě neúspěšné obhajoby není možné odstoupit od zkoušení. - Návrh témat kvalifikačních prací a témata obhájených pracíPříklady témat závěrečných prací:
1) Nástroje pro virtuální screening: https://is.muni.cz/auth/th/207622/fi_m/
2) Webový modul pro monitorování a analýzu robustnosti temporálních vlastností biologických systémů : https://is.muni.cz/auth/th/370772/fi_m/
3)Zpracování experimentálních dat ve vazbě na modely FGFR signálních drah: https://is.muni.cz/auth/th/324426/fi_m/
4) Softwarový nástroj pro automatický návrh mutací a chytrých knihoven pro proteinové inženýrství: https://is.muni.cz/auth/th/113869/fi_m/
5) Analýza plastidových genomů rostlin z NGS dat a její aplikace: https://is.muni.cz/auth/th/374224/fi_m/
Doporučený průchod studijním plánem
Povinné předměty studijního programu
Kód | Název | Ukončení | Kreditů | Semestr | Profilace |
FI:MA012 | Statistics II | zk | 3+2 | 1 | P |
FI:IV126 | Fundamentals of Artificial Intelligence | zk | 3+2 | 1 | Z |
FI:PA234 | Infrastuctural and Cloud Systems | zk | 3+2 | 2 | - |
FI:PA152 | Efficient Use of Database Systems | zk | 3+2 | 2 | Z |
FI:PV021 | Neural Networks | zk | 4+2 | 3 | Z |
FI:PV056 | Machine Learning and Data Mining | zk | 3+2 | 2 | Z |
FI:PV211 | Introduction to Information Retrieval | zk | 3+2 | 2 | Z |
FI:PV251 | Visualization | zk | 3+2 | 1 | Z |
FI:SOBHA | Obhajoba závěrečné práce | SZk | - | 4 | - |
FI:SZMGR | Státní zkouška (magisterský studijní program) | SZk | - | 4 | - |
41 kreditů |
Diplomová práce
Povinnost získat 20 kreditů z předmětu SDIPR.
Kód | Název | Ukončení | Kreditů | Semestr | Profilace |
FI:SDIPR | Diplomová práce | z | 20 | 4 | - |
20 kreditů |
Povinné předměty specializace
Kód | Název | Ukončení | Kreditů | Semestr | Profilace |
FI:IV106 | Bioinformatics seminar | k | 1+1 | 4 | - |
FI:IV108 | Bioinformatika II | zk | 2+2 | 1 | P |
FI:IV110 | Project in Sequence Analysis | k | 2+1 | 3 | - |
FI:IV120 | Spojité a hybridní systémy | zk | 3+2 | 3 | P |
FI:PA054 | Formální modely v systémové biologii | zk | 2+2 | 2 | P |
FI:PA183 | Projekt ze systémové biologie | k | 2+1 | 3 | P |
FI:PB050 | Modelování a predikce v systémové biologii | zk | 2+2 | 1 | P |
FI:PB172 | Seminář ze systémové biologie | k | 2+1 | 2 | - |
FI:PV225 | Laboratoř systémové biologie | k | 3+1 | 3 | - |
FI:PV290 | Chemoinformatics | k | 2+1 | 1 | - |
35 kreditů |
Alespoň 1 předmět doplňující praktické znalosti
Volitelné kredity
Absolvovat další předměty tak, aby celkový zisk kreditů byl minimálně 120 kreditů za celé studium tohoto studijního programu.