FI:IV106 Bionformatics seminar - Informace o předmětu
IV106 Bionformatics seminar
Fakulta informatikyjaro 2012
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Předpoklady
- Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 42 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Společným tématem semináře pro jaro je "Analýza genomových sekvencí, určování polohy a funkce genů, promotorů a jiných elementů".
Absolvováním předmětu student získá přehled o vědeckých problémech řešených v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se v schopnosti vystupovat před publikem a vést diskuzi. - Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci). Příklady témat:
- Identifikace genů v sekvenci DNA
- Metody hodnocení podobnosti sekvencí
- Vyhledávaní vzorů v sekvencích DNA
- Modelování sekundární struktury DNA a RNA
- Literatura
- ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info
- Výukové metody
- studentský seminář a diskuse
- Metody hodnocení
- Studenti samostatně nastudují a odprezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí. V případě absence absolvuje student ústní zkoušku.
- Vyučovací jazyk
- Angličtina
- Navazující předměty
- Informace učitele
- http://www.fi.muni.cz/~lexa/
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Proteins) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB). - Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
- Statistika zápisu (jaro 2012, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/fi/jaro2012/IV106