Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2025
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
Mgr. Tibor Botka, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Ing. Eliška Kučerová (pomocník)
Garance
Mgr. Tibor Botka, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Tibor Botka, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Bi6400 Metody molekulární biologie
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 15 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/15, pouze zareg.: 18/15
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu; Stanovení titru virionů; Stanovení jednostupňové růstové křivky a fágového výnosu pomocí kvantitativní PCR; Stanovení mutačního indexu; Indukce profága mitomycinem C; Izolace spontánních mutant kayvirů na rezistentních kmenech Staphylococcus aureus; komparativní analýza změn ve virovém genomu pomocí PCR, sekvenování a bioinformatické analýzy; Purifikace a zakoncentrování virových částic. Po absolvování tohoto kurzu student získá ucelenou představu o průběhu experimentů, od získání vstupního materiálu až po analýzu a interpretaci získaných experimentálních dat.
Výstupy z učení
Student bude po absolvování předmětu schopen:
• izolovat virové částice a DNA v dostatečné kvalitě a množství
• analyzovat izolovaný genetický materiál molekulárně biologickými metodami, jako je PCR, qPCR, ELFO, sekvenace DNA, a také pomocí bioinformatických nástrojů
• izolovat a vytvořit lyzát spontánní virové mutanty schopné lyzovat dosud rezistentní bakteriální kmen
• pozorovat a porovnat růstové vlastnosti bakteriálního viru
• pozorovat a porovnat růstové vlastnosti lyzogenního kmene v závislosti na typu profága a použitém režimu jeho indukce
• využít teoretické znalosti dalších metod a principů v následné laboratorní praxi
Osnova
  • 1. Izolace spontánních mutant bakteriálních virů, stanovení frekvence mutace a sekvenční analýza 2. Stanovení citlivosti kmenů Staphylococcus aureus k mutantám polyvalentního kayviru 3. Jednostupňová růstová křivka a adsorpční křivka stafylokokového viru 812 a jeho mutant, stanovení fágového výnosu pomocí qPCR 4. Pozorování růstových vlastností lyzogenních bakterií s využitím spektrofotometru, indukce mitomycinem C a izolace rezidentních bakteriálních virů 5. Purifikace virových částic různými ultrafiltračními technikami
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá formou praktického cvičení. Studenti provádějí laboratorní experimenty v jednotlivých úlohách, seřazených dle osnovy předmětu. Podklady a návody jsou pro studenty vyvěšeny ve studijních materiálech na Isu.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech laboratorních úloh, zápočtového testu a odevzdání všech protokolů.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena praktická dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky, vypracovat protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test.
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2024
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
Mgr. Tibor Botka, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Ing. Eliška Kučerová (pomocník)
Garance
Mgr. Tibor Botka, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Tibor Botka, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
Bi8312/01: Po 19. 2. až Ne 26. 5. Út 9:00–12:50 E25/119, T. Botka
Bi8312/02: Po 19. 2. až Ne 26. 5. Út 9:00–12:50 E25/119, T. Botka
Předpoklady
Bi6400 Metody molekulární biologie
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 15 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 6/15, pouze zareg.: 0/15
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu; Stanovení titru virionů; Stanovení jednostupňové růstové křivky a fágového výnosu pomocí kvantitativní PCR; Stanovení mutačního indexu; Indukce profága mitomycinem C; Izolace spontánních mutant kayvirů na rezistentních kmenech Staphylococcus aureus; komparativní analýza změn ve virovém genomu pomocí PCR, sekvenování a bioinformatické analýzy; Purifikace a zakoncentrování virových částic. Po absolvování tohoto kurzu student získá ucelenou představu o průběhu experimentů, od získání vstupního materiálu až po analýzu a interpretaci získaných experimentálních dat.
Výstupy z učení
Student bude po absolvování předmětu schopen:
• izolovat virové částice a DNA v dostatečné kvalitě a množství
• analyzovat izolovaný genetický materiál molekulárně biologickými metodami, jako je PCR, qPCR, ELFO, sekvenace DNA, a také pomocí bioinformatických nástrojů
• izolovat a vytvořit lyzát spontánní virové mutanty schopné lyzovat dosud rezistentní bakteriální kmen
• pozorovat a porovnat růstové vlastnosti bakteriálního viru
• pozorovat a porovnat růstové vlastnosti lyzogenního kmene v závislosti na typu profága a použitém režimu jeho indukce
• využít teoretické znalosti dalších metod a principů v následné laboratorní praxi
Osnova
  • 1. Izolace spontánních mutant bakteriálních virů, stanovení frekvence mutace a sekvenční analýza 2. Stanovení citlivosti kmenů Staphylococcus aureus k mutantám polyvalentního kayviru 3. Jednostupňová růstová křivka a adsorpční křivka stafylokokového viru 812 a jeho mutant, stanovení fágového výnosu pomocí qPCR 4. Pozorování růstových vlastností lyzogenních bakterií s využitím spektrofotometru, indukce mitomycinem C a izolace rezidentních bakteriálních virů 5. Purifikace virových částic různými ultrafiltračními technikami
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá formou praktického cvičení. Studenti provádějí laboratorní experimenty v jednotlivých úlohách, seřazených dle osnovy předmětu. Podklady a návody jsou pro studenty vyvěšeny ve studijních materiálech na Isu.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech laboratorních úloh, zápočtového testu a odevzdání všech protokolů.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena praktická dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky, vypracovat protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2023
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
Mgr. Tibor Botka, Ph.D. (cvičící)
Garance
Mgr. Tibor Botka, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Tibor Botka, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
Bi8312/01: Út 8:00–11:50 E25/119, T. Botka
Bi8312/02: Út 8:00–11:50 E25/119, T. Botka
Předpoklady
Bi6400 Metody molekulární biologie
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 15 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 5/15, pouze zareg.: 0/15
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu; Stanovení titru virionů; Stanovení jednostupňové růstové křivky a fágového výnosu pomocí kvantitativní PCR; Stanovení mutačního indexu; Indukce profága mitomycinem C; Izolace spontánních mutant kayvirů na rezistentních kmenech Staphylococcus aureus; komparativní analýza změn ve virovém genomu pomocí PCR, sekvenování a bioinformatické analýzy; Purifikace a zakoncentrování virových částic. Po absolvování tohoto kurzu student získá ucelenou představu o průběhu experimentů, od získání vstupního materiálu až po analýzu a interpretaci získaných experimentálních dat.
Výstupy z učení
Student bude po absolvování předmětu schopen:
• izolovat virové částice a DNA v dostatečné kvalitě a množství
• analyzovat izolovaný genetický materiál molekulárně biologickými metodami, jako je PCR, qPCR, ELFO, sekvenace DNA, a také pomocí bioinformatických nástrojů
• izolovat a vytvořit lyzát spontánní virové mutanty schopné lyzovat dosud rezistentní bakteriální kmen
• pozorovat a porovnat růstové vlastnosti bakteriálního viru
• pozorovat a porovnat růstové vlastnosti lyzogenního kmene v závislosti na typu profága a použitém režimu jeho indukce
• využít teoretické znalosti dalších metod a principů v následné laboratorní praxi
Osnova
  • 1. Izolace spontánních mutant bakteriálních virů, stanovení frekvence mutace a sekvenční analýza 2. Stanovení citlivosti kmenů Staphylococcus aureus k mutantám polyvalentního kayviru 3. Jednostupňová růstová křivka a adsorpční křivka stafylokokového viru 812 a jeho mutant, stanovení fágového výnosu pomocí qPCR 4. Pozorování růstových vlastností lyzogenních bakterií s využitím spektrofotometru, indukce mitomycinem C a izolace rezidentních bakteriálních virů 5. Purifikace virových částic různými ultrafiltračními technikami
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá formou praktického cvičení. Studenti provádějí laboratorní experimenty v jednotlivých úlohách, seřazených dle osnovy předmětu. Podklady a návody jsou pro studenty vyvěšeny ve studijních materiálech na Isu.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech laboratorních úloh, zápočtového testu a odevzdání všech protokolů.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena praktická dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky, vypracovat protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2022
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
Mgr. Tibor Botka, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
Bi8312/01: St 8:00–11:50 E25/119, T. Botka
Bi8312/02: St 8:00–11:50 E25/119, T. Botka
Předpoklady
Bi6400 Metody molekulární biologie
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 15 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/15, pouze zareg.: 0/15
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu; Stanovení titru virionů; Stanovení jednostupňové růstové křivky a fágového výnosu pomocí kvantitativní PCR; Stanovení mutačního indexu; Indukce profága mitomycinem C; Izolace spontánních mutant kayvirů na rezistentních kmenech Staphylococcus aureus; komparativní analýza změn ve virovém genomu pomocí PCR, sekvenování a bioinformatické analýzy; Purifikace a zakoncentrování virových částic. Po absolvování tohoto kurzu student získá ucelenou představu o průběhu experimentů, od získání vstupního materiálu až po analýzu a interpretaci získaných experimentálních dat.
Výstupy z učení
Student bude po absolvování předmětu schopen:
• izolovat virové částice a DNA v dostatečné kvalitě a množství
• analyzovat izolovaný genetický materiál molekulárně biologickými metodami, jako je PCR, qPCR, ELFO, sekvenace DNA, a také pomocí bioinformatických nástrojů
• izolovat a vytvořit lyzát spontánní virové mutanty schopné lyzovat dosud rezistentní bakteriální kmen
• pozorovat a porovnat růstové vlastnosti bakteriálního viru
• pozorovat a porovnat růstové vlastnosti lyzogenního kmene v závislosti na typu profága a použitém režimu jeho indukce
• využít teoretické znalosti dalších metod a principů v následné laboratorní praxi
Osnova
  • 1. Izolace spontánních mutant bakteriálních virů, stanovení frekvence mutace a sekvenční analýza 2. Stanovení citlivosti kmenů Staphylococcus aureus k mutantám polyvalentního kayviru 3. Jednostupňová růstová křivka a adsorpční křivka stafylokokového viru 812 a jeho mutant, stanovení fágového výnosu pomocí qPCR 4. Pozorování růstových vlastností lyzogenních bakterií s využitím spektrofotometru, indukce mitomycinem C a izolace rezidentních bakteriálních virů 5. Purifikace virových částic různými ultrafiltračními technikami
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá formou praktického cvičení. Studenti provádějí laboratorní experimenty v jednotlivých úlohách, seřazených dle osnovy předmětu. Podklady a návody jsou pro studenty vyvěšeny ve studijních materiálech na Isu.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech laboratorních úloh, zápočtového testu a odevzdání všech protokolů.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena praktická dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky, vypracovat protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2021
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
Mgr. Tibor Botka, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
Bi8312/B1: Po 14. 6. 8:00–12:00 E25/119, Út 15. 6. 8:00–12:00 E25/119, St 16. 6. 8:00–12:00 E25/119, Čt 17. 6. 8:00–12:00 E25/119
Bi8312/B2: Po 21. 6. 8:00–12:00 E25/119, Út 22. 6. 8:00–12:00 E25/119, St 23. 6. 8:00–12:00 E25/119, Čt 24. 6. 8:00–12:00 E25/119
Předpoklady
Bi6400 Metody molekulární biologie
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 15 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 1/15, pouze zareg.: 0/15
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu; Stanovení titru virionů; Stanovení jednostupňové růstové křivky a fágového výnosu pomocí kvantitativní PCR; Stanovení mutačního indexu; Indukce profága mitomycinem C; Izolace spontánních mutant kayvirů na rezistentních kmenech Staphylococcus aureus; komparativní analýza změn ve virovém genomu pomocí PCR, sekvenování a bioinformatické analýzy; Purifikace a zakoncentrování virových částic. Po absolvování tohoto kurzu student získá ucelenou představu o průběhu experimentů, od získání vstupního materiálu až po analýzu a interpretaci získaných experimentálních dat.
Výstupy z učení
Student bude po absolvování předmětu schopen:
• izolovat virové částice a DNA v dostatečné kvalitě a množství
• analyzovat izolovaný genetický materiál molekulárně biologickými metodami, jako je PCR, qPCR, ELFO, sekvenace DNA, a také pomocí bioinformatických nástrojů
• izolovat a vytvořit lyzát spontánní virové mutanty schopné lyzovat dosud rezistentní bakteriální kmen
• pozorovat a porovnat růstové vlastnosti bakteriálního viru
• pozorovat a porovnat růstové vlastnosti lyzogenního kmene v závislosti na typu profága a použitém režimu jeho indukce
• využít teoretické znalosti dalších metod a principů v následné laboratorní praxi
Osnova
  • 1. Izolace spontánních mutant bakteriálních virů, stanovení frekvence mutace a sekvenční analýza 2. Stanovení citlivosti kmenů Staphylococcus aureus k mutantám polyvalentního kayviru 3. Jednostupňová růstová křivka a adsorpční křivka stafylokokového viru 812 a jeho mutant, stanovení fágového výnosu pomocí qPCR 4. Pozorování růstových vlastností lyzogenních bakterií s využitím spektrofotometru, indukce mitomycinem C a izolace rezidentních bakteriálních virů 5. Purifikace virových částic různými ultrafiltračními technikami
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá formou blokového cvičení. Studenti provádějí laboratorní experimenty v jednotlivých úlohách, seřazených dle osnovy předmětu. Podklady a návody jsou pro studenty vyvěšeny ve studijních materiálech na Isu.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech laboratorních úloh, zápočtového testu a odevzdání všech protokolů.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena praktická dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky, vypracovat protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2020
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
Mgr. Tibor Botka, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Bi6400 Metody molekulární biologie
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 15 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/15, pouze zareg.: 0/15
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu; Stanovení titru virionů; Stanovení jednostupňové růstové křivky a fágového výnosu pomocí kvantitativní PCR; Stanovení mutačního indexu; Indukce profága mitomycinem C; Izolace spontánních mutant kayvirů na rezistentních kmenech Staphylococcus aureus; komparativní analýza změn ve virovém genomu pomocí PCR, sekvenování a bioinformatické analýzy; Purifikace a zakoncentrování virových částic. Po absolvování tohoto kurzu student získá ucelenou představu o průběhu experimentů, od získání vstupního materiálu až po analýzu a interpretaci získaných experimentálních dat.
Výstupy z učení
Student bude po absolvování předmětu schopen:
• izolovat virové částice a DNA v dostatečné kvalitě a množství
• analyzovat izolovaný genetický materiál molekulárně biologickými metodami, jako je PCR, qPCR, ELFO, sekvenace DNA, a také pomocí bioinformatických nástrojů
• izolovat a vytvořit lyzát spontánní virové mutanty schopné lyzovat dosud rezistentní bakteriální kmen
• pozorovat a porovnat růstové vlastnosti bakteriálního viru
• pozorovat a porovnat růstové vlastnosti lyzogenního kmene v závislosti na typu profága a použitém režimu jeho indukce
• využít teoretické znalosti dalších metod a principů v následné laboratorní praxi
Osnova
  • 1. Izolace spontánních mutant bakteriálních virů, stanovení frekvence mutace a sekvenční analýza 2. Stanovení citlivosti kmenů Staphylococcus aureus k mutantám polyvalentního kayviru 3. Jednostupňová růstová křivka a adsorpční křivka stafylokokového viru 812 a jeho mutant, stanovení fágového výnosu pomocí qPCR 4. Pozorování růstových vlastností lyzogenních bakterií s využitím spektrofotometru, indukce mitomycinem C a izolace rezidentních bakteriálních virů 5. Purifikace virových částic různými ultrafiltračními technikami
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá formou blokového cvičení. Studenti provádějí laboratorní experimenty v jednotlivých úlohách, seřazených dle osnovy předmětu. Podklady a návody jsou pro studenty vyvěšeny ve studijních materiálech na Isu.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech laboratorních úloh, zápočtového testu a odevzdání všech protokolů.
Informace učitele

Z důvodu pandemie koronaviru proběhne výuka předmětu v roce 2020 formou blokové výuky v období 1.6.-30.6.2020, v případě nevyhovující epidemiologické situace pak nejpozději do 30.9.2020. Konkrétní termín bude upřesněn prostřednictvím speciálního rozvrhu nejpozději koncem května.

Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena praktická dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky, vypracovat protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2019
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
Mgr. Tibor Botka, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Bi6400 Metody molekulární biologie
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů. Po absolvování tohoto kurzu bude student schopen kvalifikovaně analyzovat genetický materiál bakteriofágového původu.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá formou blokového cvičení. Studenti provádějí laboratorní experimenty v jednotlivých úlohách, seřazených dle osnovy předmětu. Podklady a návody jsou pro studenty vyvěšeny ve studijních materiálech na Isu.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech laboratorních úloh, zápočtového testu a odevzdání protokolů.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena praktická dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky, vypracovat protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test Students would independently manage the entered tasks and corectly interpret the results in laboratory protocols.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2018
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Bi6400 Metody molekulární biologie
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů. Po absolvování tohoto kurzu bude student schopen kvalifikovaně analyzovat genetický materiál bakteriofágového původu.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá formou blokového cvičení. Studenti provádějí laboratorní experimenty v jednotlivých úlohách, seřazených dle osnovy předmětu. Podklady a návody jsou pro studenty vyvěšeny ve studijních materiálech na Isu.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech laboratorních úloh, zápočtového testu a odevzdání protokolů.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena praktická dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky, vypracovat protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test Students would independently manage the entered tasks and corectly interpret the results in laboratory protocols.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2017
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Bi6400 Metody molekulární biologie
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů. Po absolvování tohoto kurzu bude student schopen kvalifikovaně analyzovat genetický materiál bakteriofágového původu.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá formou blokového cvičení. Studenti provádějí laboratorní experimenty v jednotlivých úlohách, seřazených dle osnovy předmětu. Podklady a návody jsou pro studenty vyvěšeny ve studijních materiálech na Isu.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech laboratorních úloh, zápočtového testu a odevzdání protokolů.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena praktická dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky, vypracovat protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test Students would independently manage the entered tasks and corectly interpret the results in laboratory protocols.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2016
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Bi6400 Metody molekulární biologie
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů. Po absolvování tohoto kurzu bude student schopen kvalifikovaně analyzovat genetický materiál bakteriofágového původu.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá formou blokového cvičení. Studenti provádějí laboratorní experimenty v jednotlivých úlohách, seřazených dle osnovy předmětu. Podklady a návody jsou pro studenty vyvěšeny ve studijních materiálech na Isu.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech laboratorních úloh, zápočtového testu a odevzdání protokolů.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena praktická dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky, vypracovat protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test Students would independently manage the entered tasks and corectly interpret the results in laboratory protocols.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2015
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Bi6400 Metody molekulární biologie
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů. Po absolvování tohoto kurzu bude student schopen kvalifikovaně analyzovat genetický materiál bakteriofágového původu.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá formou blokového cvičení. Studenti provádějí laboratorní experimenty v jednotlivých úlohách, seřazených dle osnovy předmětu. Podklady a návody jsou pro studenty vyvěšeny ve studijních materiálech na Isu.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech laboratorních úloh, zápočtového testu a odevzdání protokolů.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena praktická dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky, vypracovat protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test Students would independently manage the entered tasks and corectly interpret the results in laboratory protocols.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2014
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Bi6400 Metody molekulární biologie
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů. Po absolvování tohoto kurzu bude student schopen kvalifikovaně analyzovat genetický materiál bakteriofágového původu.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá formou blokového cvičení. Studenti provádějí laboratorní experimenty v jednotlivých úlohách, seřazených dle osnovy předmětu. Podklady a návody jsou pro studenty vyvěšeny ve studijních materiálech na Isu.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech laboratorních úloh, zápočtového testu a odevzdání protokolů.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena praktická dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky, vypracovat protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test Students would independently manage the entered tasks and corectly interpret the results in laboratory protocols.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2013
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Bi6400 Metody molekulární biologie
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů. Po absolvování tohoto kurzu bude student schopen kvalifikovaně analyzovat genetický materiál bakteriofágového původu.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá formou blokového cvičení. Studenti provádějí laboratorní experimenty v jednotlivých úlohách, seřazených dle osnovy předmětu. Podklady a návody jsou pro studenty vyvěšeny ve studijních materiálech na Isu.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech laboratorních úloh, zápočtového testu a odevzdání protokolů.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena praktická dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky, vypracovat protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test Students would independently manage the entered tasks and corectly interpret the results in laboratory protocols.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2012
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
( Ex_2979 Metody molekulární biologie || Ex_2980 Metody molekulární genetiky || B6390 Metody molekulární genetiky || B6400 Metody molekulární biologie || Bi6400 Metody molekulární biologie ) && ( B7140 Molekulární biologie virů || Bi7140 Molekulární biologie virů ) && ! Bi5491 Prakt. z mol. diagnostiky
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů. Po absolvování tohoto kurzu bude student schopen kvalifikovaně analyzovat genetický materiál bakteriofágového původu.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá formou blokového cvičení. Studenti provádějí laboratorní experimenty v jednotlivých úlohách, seřazených dle osnovy předmětu. Podklady a návody jsou pro studenty vyvěšeny ve studijních materiálech na Isu.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech laboratorních úloh, zápočtového testu a odevzdání protokolů.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena praktická dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky, vypracovat protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test Students would independently manage the entered tasks and corectly interpret the results in laboratory protocols.
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2011
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Mgr. et Mgr. Veronika Oškerová, Ph.D. (pomocník)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Předpoklady
( Ex_2979 Metody molekulární biologie || Ex_2980 Metody molekulární genetiky || B6390 Metody molekulární genetiky || B6400 Metody molekulární biologie || Bi6400 Metody molekulární biologie ) && ( B7140 Molekulární biologie virů || Bi7140 Molekulární biologie virů ) && ! Bi5491 Prakt. z mol. diagnostiky
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů. Po absolvování tohoto kurzu bude student schopen kvalifikovaně analyzovat genetický materiál bakteriofágového původu.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá formou blokového cvičení. Studenti provádějí laboratorní experimenty v jednotlivých úlohách, seřazených dle osnovy předmětu. Podklady a návody jsou pro studenty vyvěšeny ve studijních materiálech na Isu.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech laboratorních úloh, zápočtového testu a odevzdání protokolů.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena praktická dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky, vypracovat protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test Students would independently manage the entered tasks and corectly interpret the results in laboratory protocols.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2010
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Předpoklady
( Ex_2979 Metody molekulární biologie || Ex_2980 Metody molekulární genetiky || B6390 Metody molekulární genetiky || B6400 Metody molekulární biologie || Bi6400 Metody molekulární biologie ) && ( B7140 Molekulární biologie virů || Bi7140 Molekulární biologie virů ) && ! Bi5491 Prakt. z mol. diagnostiky
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů. Po absolvování tohoto kurzu bude student schopen kvalifikovaně analyzovat genetický materiál bakteriofágového původu.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá formou blokového cvičení. Studenti provádějí laboratorní experimenty v jednotlivých úlohách, seřazených dle osnovy předmětu. Podklady a návody jsou pro studenty vyvěšeny ve studijních materiálech na Isu.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech laboratorních úloh, zápočtového testu a odevzdání protokolů.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena praktická dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky, vypracovat protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test Students would independently manage the entered tasks and corectly interpret the results in laboratory protocols.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2009
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Předpoklady
( Ex_2979 Metody molekulární biologie || Ex_2980 Metody molekulární genetiky || B6390 Metody molekulární genetiky || B6400 Metody molekulární biologie || Bi6400 Metody molekulární biologie ) && ( B7140 Molekulární biologie virů || Bi7140 Molekulární biologie virů ) && ! Bi5491 Prakt. z mol. diagnostiky
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů. Po absolvování tohoto kurzu bude student schopen kvalifikovaně pracovat s genetickým materiálem bakteriofágového původu.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Metody hodnocení
Výuka: praktické cvičení, zápočet: písemné testové otázky, protokoly.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky. Odevzdat na závěr výuky protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test Students would independently manage the entered tasks and corectly interpret the results.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2008
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Předpoklady
( Ex_2979 Metody molekulární biologie || Ex_2980 Metody molekulární genetiky || B6390 Metody molekulární genetiky || B6400 Metody molekulární biologie || Bi6400 Metody molekulární biologie ) && ( B7140 Molekulární biologie virů || Bi7140 Molekulární biologie virů ) && ! Bi5491 Prakt. z mol. diagnostiky
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Metody hodnocení
Výuka: praktické cvičení, zápočet: písemné testové otázky, protokoly.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky. Odevzdat na závěr výuky protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2007
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Předpoklady
( Ex_2979 Metody molekulární biologie || Ex_2980 Metody molekulární genetiky || B6390 Metody molekulární genetiky || B6400 Metody molekulární biologie || Bi6400 Metody molekulární biologie ) && ( B7140 Molekulární biologie virů || Bi7140 Molekulární biologie virů ) && ! Bi5491 Prakt. z mol. diagnostiky
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Metody hodnocení
Výuka: praktické cvičení, zápočet: písemné testové otázky, protokoly.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky. Odevzdat na závěr výuky protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2006
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Předpoklady
( Ex_2979 Metody molekulární biologie || Ex_2980 Metody molekulární genetiky || B6390 Metody molekulární genetiky || B6400 Metody molekulární biologie || Bi6400 Metody molekulární biologie ) && Bi7311 Prakt. z mol. biol. prokaryot && ( B7140 Molekulární biologie virů || Bi7140 Molekulární biologie virů )
1. Základní metody molekulární biologie 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Metody hodnocení
Výuka: praktické cvičení, zápočet: písemné testové otázky, protokoly.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky. Odevzdat na závěr výuky protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2005
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Předpoklady
( Ex_2979 Metody molekulární biologie || Ex_2980 Metody molekulární genetiky || B6390 Metody molekulární genetiky || B6400 Metody molekulární biologie || Bi6400 Metody molekulární biologie ) && Bi7311 Prakt. z mol. biol. prokaryot && ( B7140 Molekulární biologie virů || Bi7140 Molekulární biologie virů )
1. Základní metody molekulární biologie 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Metody hodnocení
Výuka: praktické cvičení, zápočet: písemné testové otázky, protokoly.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky. Odevzdat na závěr výuky protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2004
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Předpoklady
( Ex_2979 Metody molekulární biologie || Ex_2980 Metody molekulární genetiky || B6390 Metody molekulární genetiky || B6400 Metody molekulární biologie || Bi6400 Metody molekulární biologie ) && Bi7311 Prakt. z mol. biol. prokaryot && ( B7140 Molekulární biologie virů || Bi7140 Molekulární biologie virů )
1. Základní metody molekulární biologie 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Metody hodnocení
Výuka: praktické cvičení, zápočet: písemné testové otázky, protokoly.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky. Odevzdat na závěr výuky protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2003
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Předpoklady
( Ex_2979 Metody molekulární biologie || Ex_2980 Metody molekulární genetiky || B6390 Metody molekulární genetiky || B6400 Metody molekulární biologie || Bi6400 Metody molekulární biologie ) && Bi7311 Prakt. z mol. biol. prokaryot && ( B7140 Molekulární biologie virů || Bi7140 Molekulární biologie virů )
1. Základní metody molekulární biologie 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Metody hodnocení
Výuka: praktické cvičení, zápočet: písemné testové otázky, protokoly.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky. Odevzdat na závěr výuky protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2012 - akreditace

Údaje z období jaro 2012 - akreditace se nezveřejňují

Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
( Ex_2979 Metody molekulární biologie || Ex_2980 Metody molekulární genetiky || B6390 Metody molekulární genetiky || B6400 Metody molekulární biologie || Bi6400 Metody molekulární biologie ) && ( B7140 Molekulární biologie virů || Bi7140 Molekulární biologie virů ) && ! Bi5491 Prakt. z mol. diagnostiky
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů. Po absolvování tohoto kurzu bude student schopen kvalifikovaně analyzovat genetický materiál bakteriofágového původu.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá formou blokového cvičení. Studenti provádějí laboratorní experimenty v jednotlivých úlohách, seřazených dle osnovy předmětu. Podklady a návody jsou pro studenty vyvěšeny ve studijních materiálech na Isu.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech laboratorních úloh, zápočtového testu a odevzdání protokolů.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena praktická dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky, vypracovat protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test Students would independently manage the entered tasks and corectly interpret the results in laboratory protocols.
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2011 - akreditace
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Předpoklady
( Ex_2979 Metody molekulární biologie || Ex_2980 Metody molekulární genetiky || B6390 Metody molekulární genetiky || B6400 Metody molekulární biologie || Bi6400 Metody molekulární biologie ) && ( B7140 Molekulární biologie virů || Bi7140 Molekulární biologie virů ) && ! Bi5491 Prakt. z mol. diagnostiky
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů. Po absolvování tohoto kurzu bude student schopen kvalifikovaně analyzovat genetický materiál bakteriofágového původu.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá formou blokového cvičení. Studenti provádějí laboratorní experimenty v jednotlivých úlohách, seřazených dle osnovy předmětu. Podklady a návody jsou pro studenty vyvěšeny ve studijních materiálech na Isu.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech laboratorních úloh, zápočtového testu a odevzdání protokolů.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena praktická dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky, vypracovat protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test Students would independently manage the entered tasks and corectly interpret the results in laboratory protocols.
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2008 - akreditace
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
Předpoklady
( Ex_2979 Metody molekulární biologie || Ex_2980 Metody molekulární genetiky || B6390 Metody molekulární genetiky || B6400 Metody molekulární biologie || Bi6400 Metody molekulární biologie ) && ( B7140 Molekulární biologie virů || Bi7140 Molekulární biologie virů ) && ! Bi5491 Prakt. z mol. diagnostiky
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10
Jiné omezení: Prosíme striktně o dodržování limitu počtu studentů
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu, Stanovení titru bakteriofága. Jednostupňová růstová křivka bakteriofága, Stanovení fágového výnosu, Stanovení mutačního indexu. Indukce bakteriofága UV zářením. Transdukce u Staphylococcus aureus. Izolace ts mutant u bakteriofágů.
Osnova
  • 1.Jednostupňová růstová křivka polyvalentního bakteriofága 812 2. Příprava mutant citlivých k vyšší teplotě kultivace (tj. ts mutanty). 3. Stanovení frekvence mutace u bakteriofágů 4. Kinetika adsorpce, konstrukce adsorpční křivky 5. Indukce profága, delyzogenizace u hostitelských buněk S. aureus. 6. Výpočet síly genové vazby a stanovení vzdálenosti mezi geny 7. Konstrukce mapy genomu fága dvou a třífaktorovým křížením 8. Stanovení fágového výnosu z jednotlivých buněk S. aureus, E. coli Poissonovou distribucí.
Literatura
  • Návody k cvičení jsou u vyučující
  • Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Metody hodnocení
Výuka: praktické cvičení, zápočet: písemné testové otázky, protokoly.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky. Odevzdat na závěr výuky protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.