PřF:Bi8312 Prakt. z mol. biol. virů - Informace o předmětu
Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
Přírodovědecká fakultajaro 2024
- Rozsah
- 0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
- Vyučující
- Mgr. Tibor Botka, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Ing. Eliška Kučerová (pomocník) - Garance
- Mgr. Tibor Botka, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Tibor Botka, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta - Rozvrh seminárních/paralelních skupin
- Bi8312/01: Po 19. 2. až Ne 26. 5. Út 9:00–12:50 E25/119, T. Botka
Bi8312/02: Po 19. 2. až Ne 26. 5. Út 9:00–12:50 E25/119, T. Botka - Předpoklady
- Bi6400 Metody molekulární biologie
1. Základní metody molekulární biologie; 2. Molekulární biologie DNA a RNA virů; 3. Životní cyklus a reprodukce genomů bakteriálních virů. - Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Předmět si smí zapsat nejvýše 15 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 6/15, pouze zareg.: 0/15 - Mateřské obory/plány
- Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-EXB)
- Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-MBG)
- Cíle předmětu
- Předmět zahrnuje techniky přípravy a kultivace bakteriálních virů: Přípravy fágového lyzátu; Stanovení titru virionů; Stanovení jednostupňové růstové křivky a fágového výnosu pomocí kvantitativní PCR; Stanovení mutačního indexu; Indukce profága mitomycinem C; Izolace spontánních mutant kayvirů na rezistentních kmenech Staphylococcus aureus; komparativní analýza změn ve virovém genomu pomocí PCR, sekvenování a bioinformatické analýzy; Purifikace a zakoncentrování virových částic. Po absolvování tohoto kurzu student získá ucelenou představu o průběhu experimentů, od získání vstupního materiálu až po analýzu a interpretaci získaných experimentálních dat.
- Výstupy z učení
- Student bude po absolvování předmětu schopen:
• izolovat virové částice a DNA v dostatečné kvalitě a množství
• analyzovat izolovaný genetický materiál molekulárně biologickými metodami, jako je PCR, qPCR, ELFO, sekvenace DNA, a také pomocí bioinformatických nástrojů
• izolovat a vytvořit lyzát spontánní virové mutanty schopné lyzovat dosud rezistentní bakteriální kmen
• pozorovat a porovnat růstové vlastnosti bakteriálního viru
• pozorovat a porovnat růstové vlastnosti lyzogenního kmene v závislosti na typu profága a použitém režimu jeho indukce
• využít teoretické znalosti dalších metod a principů v následné laboratorní praxi - Osnova
- 1. Izolace spontánních mutant bakteriálních virů, stanovení frekvence mutace a sekvenční analýza 2. Stanovení citlivosti kmenů Staphylococcus aureus k mutantám polyvalentního kayviru 3. Jednostupňová růstová křivka a adsorpční křivka stafylokokového viru 812 a jeho mutant, stanovení fágového výnosu pomocí qPCR 4. Pozorování růstových vlastností lyzogenních bakterií s využitím spektrofotometru, indukce mitomycinem C a izolace rezidentních bakteriálních virů 5. Purifikace virových částic různými ultrafiltračními technikami
- Literatura
- Návody k cvičení jsou u vyučující
- Virology methods manual. Edited by B. W. J. Mahy - Hillar O. Kangro. London: Academic Press, 1996, x, 374. ISBN 0124653308. info
- SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
- ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
- Výukové metody
- Výuka probíhá formou praktického cvičení. Studenti provádějí laboratorní experimenty v jednotlivých úlohách, seřazených dle osnovy předmětu. Podklady a návody jsou pro studenty vyvěšeny ve studijních materiálech na Isu.
- Metody hodnocení
- Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech laboratorních úloh, zápočtového testu a odevzdání všech protokolů.
- Informace učitele
- Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena praktická dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky, vypracovat protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test.
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
- Statistika zápisu (nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2024/Bi8312