C9041 Struktura a funkce eukaryotických chromozomů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2025
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.
Vyučováno kontaktně
Vyučující
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc. (přednášející)
doc. Mgr. Miloslava Fojtová, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. Martin Falk, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
znalost základů biochemie a molekulární biologie
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Hlavní cíle kursu jsou: seznámit studenty se s aktuálním stavem poznání o struktuře chromatinu jako nositeli genetické i epigenetické informace
Na konci tohoto kursu bude bude student schopen porozumět současným poznatkům z oblasti molekulární podstaty epigenetických procesů
Získá přehled o struktuře a funkci centromer, telomer a replikačních počátků
Výstupy z učení
Student bude po absolvování předmětu rozumět principům uspořádání genetické informace v chromozomech a modulaci její exprese prostřednictvím epigenetických procesů modifikujících strukturu chromatinu.
Osnova
  • Přednášky jsou zaměřeny na popis struktury eukaryotických chromozómů a jejích dynamických změn při základních procesech metabolizmu genetického materiálu - replikaci, transkripci a opravách. Kromě vztahu k funkci genů bude kladen důraz na možné i prokázané funkce tzv. nekódujících sekvencí, které tvoří DNA komponenty nezbytných chromozomálních funkčních elementů - centromer a telomer.
  • Osnova: 1. Eukaryotické genomy: velikost, složení, struktura, komplexita
  • 2. Uspořádání jaderného genomu – chromatin
  • 3. Translační a rotační poloha nukleozómu
  • 4. Co se děje s nukleozómy při transkripci a replikaci.
  • 5. Epigenetika – konec fatalismu v genetice. Přehled epigenetických procesů a příklady biologických funkcí
  • 6. Molekulární podstata epigenetických procesů: Methylace DNA, posttranslační modifikace histonů, RNA interference, histonové varianty, remodelace chromatinu. Metody analýz.
  • 7. Nehistonové proteiny chromatinu
  • 8. Struktura chromatinu vyššího řádu a metody její analýzy
  • 9. Centromery – struktura a funkce.
  • 10. Telomery – struktura a funkce. Příklady aktuálních výzkumných projektů a výsledků
  • 11. Replikační počátky a regulace replikace. Metody mapování replikačních počátků.
  • 12. Opravy poškození DNA
Literatura
  • Bryan M. Turner: Chromatin and gene regulation. Molecular mechanisms in epigenetics. Blackwell Science Ltd. ISBN 0-865-42743-7
  • T.A. Brown: GENOMES. Bios Scientific Publishers Ltd. 1999,Oxford.
  • C.R. Calladine, H.R. Drew: Understanding DNA.Second edition. Academic Press N.Y. 1997
  • FAJKUS, Jiří a Ulrike ZENTGRAF. Structure and Maintenance of Chromosome Ends in Plants. In Telomerases, Telomeres and Cancer. Georgetown, New York: Landes Bioscience, Kluwer Academic, 2002, s. 314-331. Molecular Biology Intelligence Unit 22. ISBN 0-306-47437-9. info
  • SNUSTAD, D. Peter a Michael J. SIMMONS. Genetika. Translated by Jiřina Relichová. Druhé, aktualizované vydá. Brno: Masarykova univerzita, 2017, xix, 844. ISBN 9788021086135. info
Výukové metody
Přednášky; rozbor příkladů výzkumných problémů z přednášené problematiky.
Metody hodnocení
Zkouška - písemná a ústní. Závěrečný písemný test předchází ústní zkoušce. Pro absolvování ústní zkoušky je třeba >50% správných odpovědí v testu. Obě části zkoušky je možno skládat v angličtině, pokud to student/-ka preferuje.
Navazující předměty
Informace učitele
Přednášky se konají v Univerzitním kampusu Bohunice, pavilon A2, není li stanoveno jinak. V jarním semestru bude výuka probíhat online formou na platformě MS Teams, dokud nebude možná kontaktní výuka. Link bude studentům zaslán před začátkem výuky v jarním semestru. e-mail: fajkus@sci.muni.cz, tel. 549494003
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2025/C9041