PřF:C9042 Analýza struktury chromatinu - Informace o předmětu

C9042 Analýza struktury chromatinu - praktikum

Rozsah

0/0/2. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: z.
Vyučováno kontaktně

Vyučující

prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc. (cvičící)
Ing. Tereza Přerovská, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Petra Procházková Schrumpfová, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Miloslava Fojtová, CSc. (cvičící)

Garance

prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

NOW( C9041 Strukt. eukar. chromozomů )
Základní znalosti molekulární biologie a biochemie, paralelní nebo předchozí absolvování kursu Struktura a funkce euk. chromozomů, znalost předpisů o BOZP v laboratoři.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/12

Mateřské obory/plány

• Genomika a proteomika (program PřF, N-BCH)
• Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-EXB)

Cíle předmětu

Kurs je praktickým cvičením k teoretickému kursu Struktura a funkce eukaryotických chromozomů (Bi9041). Cílem je, aby na základě absolvování kursu student získal praktickou zkušenost s metodami používanými při analýze struktury chromozomů a chromatinu.
Seznámit prakticky studenty s metodami přípravy buněč. jader
Seznámit prakticky studenty s metodami extrakce a elektroforézy histonů
Seznámit prakticky studenty s metodami štěpení chromatinu MNázou
Student bude schopen modifikovat pracovní postup podle zvoleného materiálu

Výstupy z učení

Po absolvování kursu student získá praktickou zkušenost s metodami používanými při analýze struktury chromozomů a chromatinu. Bude:
- prakticky bude obeznámen s metodami přípravy buněčných jader;
- bude prakticky obeznámen s metodami extrakce a elektroforézy histonů;
- bude prakticky obeznámen s metodami štěpení chromatinu MNázou;
- bude schopen modifikovat pracovní postup podle zvoleného materiálu.

Osnova

• 1. Izolace buněčných jader z živočišných a rostlinných tkání 2. Štěpení jader mikrokokovou nukleázou 3. Extrakce nukleozomální DNA 3. Analýza nukleozomální DNA pomocí elektroforézy 4. Příprava mononukleozomální DNA z agarózového gelu 5. mapování polohy nukleozómu pomocí restrikčních enzymů nebo extenze primerů 6. Počítačové modelování polohy nukleozómů 7. Porovnání experimentálních a teoretických výsledků. 8. Extrakce chromatinových proteinů 9. Analýza chromatinových proteinů pomocí SDS-PAGE

Literatura

• FAJKUS, Jiří, Andrew R. LEITCH, Michael CHESTER a Eva SÝKOROVÁ. Evolution, Composition and Interrelated Functions of Telomeres and Subtelomeres: Lessons from Plants. In Origin and Evolution of Telomeres. USA: Landes Biosciences, 2008, s. 114-127. ISBN 978-1-58706-309-1. info
• FAJKUS, Jiří a Edward N. TRIFONOV. Columnar Packing of Telomeric Nucleosomes. Biochemical and Biophysical Research Communications. California: Academic Press, 2001, roč. 280, č. 4, s. 961-963. ISSN 0006-291X. info

Výukové metody

Laboratorní cvičení - intenzivní bloková výuka

Metody hodnocení

Písemné vypracování protokolu zdůrazňujícího problémy, s nimiž při řešení projektu došlo. Závěrečná skupinová diskuse o zkušenostech z kursu.

Informace učitele

Předmět se vyučuje blokově v laboratořích pav. A2-ILBIT, univerzitní kampus Brno-Bohunice

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

• Statistika zápisu (nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2025/C9042