PřF:C9042 Analýza struktury chromatinu - Informace o předmětu
C9042 Analýza struktury chromatinu - praktikum
Přírodovědecká fakultajaro 2025
- Rozsah
- 0/0/2. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: z.
Vyučováno kontaktně - Vyučující
- prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc. (cvičící)
Ing. Tereza Přerovská, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Petra Procházková Schrumpfová, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Miloslava Fojtová, CSc. (cvičící) - Garance
- prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta - Předpoklady
- NOW( C9041 Strukt. eukar. chromozomů )
Základní znalosti molekulární biologie a biochemie, paralelní nebo předchozí absolvování kursu Struktura a funkce euk. chromozomů, znalost předpisů o BOZP v laboratoři. - Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/12 - Mateřské obory/plány
- Genomika a proteomika (program PřF, N-BCH)
- Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-EXB)
- Cíle předmětu
- Kurs je praktickým cvičením k teoretickému kursu Struktura a funkce eukaryotických chromozomů (Bi9041).
Cílem je, aby na základě absolvování kursu student získal praktickou zkušenost s metodami používanými při analýze struktury chromozomů a chromatinu.
Seznámit prakticky studenty s metodami přípravy buněč. jader
Seznámit prakticky studenty s metodami extrakce a elektroforézy histonů
Seznámit prakticky studenty s metodami štěpení chromatinu MNázou
Student bude schopen modifikovat pracovní postup podle zvoleného materiálu - Výstupy z učení
- Po absolvování kursu student získá praktickou zkušenost s metodami používanými při analýze struktury chromozomů a chromatinu. Bude:
- prakticky bude obeznámen s metodami přípravy buněčných jader;
- bude prakticky obeznámen s metodami extrakce a elektroforézy histonů;
- bude prakticky obeznámen s metodami štěpení chromatinu MNázou;
- bude schopen modifikovat pracovní postup podle zvoleného materiálu. - Osnova
- 1. Izolace buněčných jader z živočišných a rostlinných tkání 2. Štěpení jader mikrokokovou nukleázou 3. Extrakce nukleozomální DNA 3. Analýza nukleozomální DNA pomocí elektroforézy 4. Příprava mononukleozomální DNA z agarózového gelu 5. mapování polohy nukleozómu pomocí restrikčních enzymů nebo extenze primerů 6. Počítačové modelování polohy nukleozómů 7. Porovnání experimentálních a teoretických výsledků. 8. Extrakce chromatinových proteinů 9. Analýza chromatinových proteinů pomocí SDS-PAGE
- Literatura
- FAJKUS, Jiří, Andrew R. LEITCH, Michael CHESTER a Eva SÝKOROVÁ. Evolution, Composition and Interrelated Functions of Telomeres and Subtelomeres: Lessons from Plants. In Origin and Evolution of Telomeres. USA: Landes Biosciences, 2008, s. 114-127. ISBN 978-1-58706-309-1. info
- FAJKUS, Jiří a Edward N. TRIFONOV. Columnar Packing of Telomeric Nucleosomes. Biochemical and Biophysical Research Communications. California: Academic Press, 2001, roč. 280, č. 4, s. 961-963. ISSN 0006-291X. info
- Výukové metody
- Laboratorní cvičení - intenzivní bloková výuka
- Metody hodnocení
- Písemné vypracování protokolu zdůrazňujícího problémy, s nimiž při řešení projektu došlo. Závěrečná skupinová diskuse o zkušenostech z kursu.
- Informace učitele
- Předmět se vyučuje blokově v laboratořích pav. A2-ILBIT, univerzitní kampus Brno-Bohunice
- Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
- Statistika zápisu (jaro 2025, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2025/C9042