PřF:S1004 Structure of biomolecules - Informace o předmětu

S1004 Methods for structural characterization of biomolecules

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

Mgr. Josef Houser, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Filip Melicher (přednášející)
MVDr. Eva Paulenová, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D. (přednášející)

Garance

Mgr. Josef Houser, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Po 13. 1. 9:00–16:50 C04/211, Út 14. 1. 9:00–16:50 C04/211, St 15. 1. 9:00–16:50 C04/211, Čt 16. 1. 9:00–16:50 C04/211, Pá 17. 1. 9:00–16:50 C04/211, 9:00–16:50 C04/118, Po 27. 1. 9:00–16:50 C04/211, Út 28. 1. 9:00–16:50 C04/211, St 29. 1. 9:00–16:50 C04/211, Čt 30. 1. 9:00–16:50 C04/211, Pá 31. 1. 9:00–16:50 C04/211

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

At the end of the course students should be able to:
characterize protein sample for structural studies
understand and explain principles of crystal structure determination of proteins
solve X-ray protein structure
interpret electron density maps, analyze and validate pdb coordinates

Výstupy z učení

At the end of the course students should be able to:
characterize protein sample for structural studies
understand and explain principles of crystal structure determination of proteins
solve X-ray protein structure
interpret electron density maps, analyze and validate pdb coordinates

Osnova

• 1. Biomolecular sample, characteristics, sample requirements 2. Sample quality analysis – stability, homogeneity 3. Structural methods for analysis of biomolecules, complementarity of techniques 4. Biomacromolecular crystals, crystallization techniques, crystallization experiment 5. Crystal properties, space group and symmetry, assymetric unit 6. Diffraction experiment, diffraciton images processing, methods for phasing, electron density 7. Structural model, density maps, model accuracy, validation, structural databases 8. Optimization of structural experiment 9. Laboratory practicals – characterization of protein sample and crystallization experiments

Literatura

doporučená literatura
• PECORA R. Dynamic Light Scattering: Applications of Photon Correlation Spectroscopy, Springer, 1985
• Bergfors, T. M. Protein Crystallization: Second Edition, Oxford University Press, 2009.
• Fundamentals of crystallography. Edited by Carmelo Giacovazzo. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2002, xix, 825 s. ISBN 0-19-850957-X. info
• Circular dichroism and the conformational analysis of biomolecules. Edited by Gerald D. Fasman. New York: Plenum Press, 1996, ix, 738 s. ISBN 0-306-45142-5. info

Výukové metody

Intensive course covering lectures and class discussion

Metody hodnocení

in-term assessment, final written test

Vyučovací jazyk

Angličtina

Informace učitele

Course is being taught as a block of lectures, discussions and laboratory exercises at the end of semester - in the examination period.

Další komentáře

Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.

• Statistika zápisu (nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2024/S1004