Bi6400 Metody molekulární biologie

Přírodovědecká fakulta
jaro 2007
Rozsah
3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
Vyučující
prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Rozvrh
Út 10:00–12:50 BR3
Předpoklady
SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).
Mateřské obory/plány
předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů metod a způsobů jejich praktického využití.
Osnova
  • 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro. 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin. 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin. 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů. 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování. 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace. 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy. 8. Zakládání genových knihoven.9. Průtoková cytometrie. 10. Transkripce a translace in vitro. 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky. 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace. 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek. 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.
Literatura
Metody hodnocení
Zkouška se provádí formou písemného testu, po kterém následuje krátký ústní pohovor.
Navazující předměty
Informace učitele
Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.
Další komentáře
Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.