Bi0440 Aktuální trendy analýzy biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2009
Rozsah
2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučující
doc. Ing. Daniel Schwarz, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D.
RECETOX – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Ing. Daniel Schwarz, Ph.D.
Rozvrh
Út 15:00–16:50 F01B1/709
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Množství dat, která reprezentují procesy, projevy a činnosti živých systémů, narůstá spolu s rapidním vývojem digitálních technologií, jež nám tato data umožňují pořizovat, přenášet a ukládat. Zvyšuje se tak i význam metod z oblasti digitálního zpracování a analýzy signálů, jejichž cílem je zvýrazňování signálů v šumu nebo transformace naměřených dat tak, aby mohly být objeveny jejich skryté vlastnosti. Na sledování aktuálních trendů v této oblasti je zaměřen právě tento předmět. Hlavní cíle předmětu jsou: rozšíření znalostí studentů o metodách pro zpracování a analýzu signálů; pochopení možností a aplikačního potenciálu těchto metod pro matematického biologa; osvojení si metod pro potlačování šumu v naměřených datech; uvedení do problematiky časo-frekvenční a vlnkové analýzy;
Osnova
  • Signály a systémy – úvod či opakování: klasifikace a příklady signálů, klasifikace a příklady systémů;
  • Diskrétní signály a jejich frekvenční analýza;
  • Časofrekvenční popis signálů – okénková Fourierova transformace;
  • Vlnková dekompozice signálů, spektrogram;
  • Vlnková transformace;
  • Analýza a zpracování dat s využitím vlnkové transformace;
  • Další aplikace vlnkové transformace;
Literatura
  • DEVASAHAYAM, Suresh R. Signals and systems in biomedical engineering : signal processing and physiological systems modeling. 1st ed. New York: Kluwer Academic/Plenum Publishers, 2000, xvi, 337. ISBN 0306463911. info
  • DRONGELEN, Wim van. Signal processing for neuroscientists : introduction to the analysis of physiological signals. Amsterdam: Academic Press, 2007, ix, 308. ISBN 9780123708670. info
  • Wavelets and their applications. Edited by Michel Misiti. London: ISTE, 2006, 330 s. ISBN 9781905209316. info
Metody hodnocení
Výukové metody: přednášky, demonstrace vybraných algoritmů na počítači.
Požadavky k ukončení: ústní zkouška
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, podzim 2010 - akreditace, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, podzim 2009, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021.