IC113 Binding Analysis for Experimental Biologists

Přírodovědecká fakulta
jaro 2014
Rozsah
0/0. 2 kr. (plus 2 za k). Ukončení: k.
Vyučující
Petr Kuzmič, Dr. (přednášející), doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D. (zástupce)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/12
Osnova
  • LECTURE TOPICS 1. Principles of data analysis: Matching models to experimental data 2. Confidence intervals for rate and equilibrium constants 3. Time course of biochemical and biophysical processes: Mathematical models 4. Experimental methods for the determination of rate constants 5. Biochemical and biophysical equilibria: Mathematical models 6. Analysis of equilibrium binding data 7. Enzyme catalysis and inhibition of enzymes 8. Choosing the appropriate molecular mechanism based on available data Notes: • All lectures will include concrete examples from published literature
  • EXERCISES 1. Determination of an equilibrium binding constant for a protein-protein or protein-DNA interaction 2. Determination of rate constants for protein-ligand interaction 3. Determination of stoichiometry protein-ligand interaction 4. Selecting an appropriate mechanism for enzyme inhibition Notes: • Practical sessions will be held in the computer laboratory using the software DynaFit • All exercises will include actual data published in the literature • Students are encouraged to bring their own additional data
Vyučovací jazyk
Angličtina
Informace učitele
http://www.biokin.com/dynafit/index.html
Intensive lecture course with practical PC sessions. We will start on Monday at 9:00, seminar room 1.21, building A2. It is possible to bring your own laptop.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován jednorázově.
Výuka probíhá blokově.
Poznámka k četnosti výuky: block lecture May 12 -16, 2014.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2014/IC113