PřF:Bi9310 Kvantitativní RT-PCR - Informace o předmětu
Bi9310 Úvod do kvantitativní RT-PCR
Přírodovědecká fakultajaro 2023
- Rozsah
- 2/0/0. v týdenním bloku. 2 kr. (plus ukončení). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
- Vyučující
- doc. RNDr. Sabina Ševčíková, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- doc. RNDr. Sabina Ševčíková, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Sabina Ševčíková, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta - Předpoklady
- Bi4035 Molekulární biologie - lab.cv. || Bi4020c Molekulární biologie - cv.
Základní přehled v oboru molekulární biologie. - Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
- Mateřské obory/plány
- Aplikovaná biochemie (program PřF, B-BIC)
- Bioanalytická laboratorní diagnostika ve zdravotnictví - Lékařská genetika a molekulární diagnostika (program PřF, N-LGM)
- Lékařská genetika a molekulární diagnostika pro odborné pracovníky v laboratorních metodách (program PřF, N-BI)
- Lékařská genetika a molekulární diagnostika (program PřF, B-BI)
- Lékařská genetika a molekulární diagnostika (program PřF, B-LGM)
- Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-EXB)
- Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-EXB, směr Antropogenetika)
- Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-EXB)
- Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-MBG)
- Cíle předmětu
- Cíle kurzu:
porozumět principům PCR a real-time PCR
navrhnout a provést úplný real-time PCR experiment
porozumět struktuře fluoroforů a sond využívaných v real-time PCR
analyzovat a vyhodnotit data pocházející z absolutní i relativní kvantifikace, SNP analýzy i High Resolution Melting Analýzy - Výstupy z učení
- Po dokončení kurzu bude student rozumět principům PCR a real-time PCR; bude schopen navrhnout a provést úplný real-time PCR experiment, včetně všech kontrol; bude mít přehled o struktuře fluoroforů a sondách využívaných v této technice a dokáže analyzovat a vyhodnocovat data získaná z absolutní i relativní kvantifikace, SNP analýzy i high resolution melting analýzy.
- Osnova
- Teorie PCR
- Semikvantitativní a real-time PCR
- Průběh reakce, end-point vs. real-time přístup
- Absolutní a relativní kvantifikace a jejich modifikace
- Vstupní materiál a jeho kvalita, reverzní transkripce
- Faktory ovlivňují PCR, normalizace experimentálního designu a dat, kalibrační křivky, účinnost PCR, návrh vlastních kontrolních experimentů
- Principy detekce
- Reportérové fluorochromy, zhášeče, struktura sond
- Design primerů a sond
- Obecné aplikace real-time PCR
- Návrh experimentu, kontroly, endogenní kontroly, správná laboratorní praxe v PCR (RNA) laboratoři
- Interpretace dat získaných z absolutní a relativní kvantifikace, SNP, +/- analýz.
- Standardy MIQE (Minimum Information for Publication of Quantitative Real-Time PCR Experiments (MIQE) guidelines)
- Literatura
- Výukové metody
- přednášky
- Metody hodnocení
- Přednášky
Ukončení: závěrečný test - Navazující předměty
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
- Statistika zápisu (jaro 2023, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2023/Bi9310