PřF:Bi7900 Genetické metody v zoologii - Informace o předmětu
Bi7900 Genetické metody v zoologii
Přírodovědecká fakultapodzim 2010 - akreditace
- Rozsah
- 2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
- Vyučující
- prof. RNDr. Miloš Macholán, CSc. (přednášející)
prof. Mgr. et Mgr. Josef Bryja, Ph.D. (přednášející) - Garance
- prof. RNDr. Miloš Macholán, CSc.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Miloš Macholán, CSc. - Předpoklady
- Bi1030 Systém a evoluce bezobratlých && Bi2090 Systém a evoluce obratlovců && Bi3060 Obecná genetika && Bi4020 Molekulární biologie || SOUHLAS
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10 - Mateřské obory/plány
- Systematická biologie a ekologie (program PřF, B-BI, směr Systematická zoologie a ekologie)
- Systematická biologie a ekologie (program PřF, N-BI, směr Systematická zoologie a ekologie)
- Cíle předmětu
- Tento předmět je určen především pro studenty magisterského a doktorského studia a měl by jim podat základní přehled o současných morfologických, cytogenetických a molekulárních metodách v současnosti běžně používaných v zoologickém výzkumu. Po jeho ukončení bude student schopen teoreticky i prakticky zvládnout následující témata: Analýza fenotypu (epigenetické znaky, kvantitativní znaky, geometrická morfometrie); Cytogenetika (analýza karyotypu, proužkování, FISH, "vybarvivání" chromozomů); Elektroforéza proteinů a DNA; Analýza DNA (izolace DNA, DNA-DNA hybridizace, PCR, real-time PCR, fingerprinting, RAPD, AFLP, analýza mikrosatelitů, LINE, SINE a SNP; sekvencování, "next generation sequencing", RFLP, DGGE, TGEE, SSCP, klonování, microarrays); Metody analýzy (populačně-genetická data: analýzy založené na frekvencích alel v populaci vs. "individual-based" modely; fylogenetická data: metody založené na vzdálenosti, maximální parsimonie, maximální věrohodnost, bayesovská analýza).
- Osnova
- Genetické metody v zoologii (sylabus přednášek a cvičení) M. Macholán, J. Bryja, M. Vyskočilová 2008/2009, podzim, 13 týdnů 1. Analýza fenotypu (signální fenotypy, epigenetické znaky, kvantitativní znaky, analýza landmarků)
- 2. Cytogenetika (analýza karyotypu, proužkování, FISH, „painting“) a elektroforetické metody (proteiny, DNA)
- 3. Analýza DNA I (izolace DNA, genetické markery - jaderná vs. mimojaderná DNA, DNA-DNA hybridizace, PCR, real-time PCR, "multi-locus" DNA markery: fingerprinting, RAPD, AFLP)
- 4. Analýza DNA II ("single-locus" DNA markery: mikrosatelity, LINE, SINE, SNP)
- 5. Analýza DNA III (sekvencování - přehled metod, "next generation sequencing")
- 6. Analýza DNA IV (SNP a jejich analýza: RFLP, DGGE, TGEE, SSCP, klonování, microarrays)
- 7. Metody analýzy I (populačně-genetická data) - analýzy založené na frekvencích alel v populaci vs. "individual-based" modely
- 8. Metody analýzy II (fylogenetická data) - metody založené na vzdálenosti, maximální parsimonie, maximální věrohodnost, bayesovské metody
- 9. Praktické cvičení v laboratoři I (zhotovení chromozomálních preparátů, analýza karyotypu)
- 10. Praktické cvičení v laboratoři II (elektroforéza enzymů)
- 11. Praktické cvičení v laboratoři III (PCR, real-time PCR)
- 12. Praktické cvičení v laboratoři IV (analýza DNA fragmentů po PCR, elektroforéza, fragmentační analýza, SSCP v kapiláře)
- 13. Praktické cvičení v laboratoři V (sekvencování)
- Literatura
- ZIMA, Jan. Genetické metody v zoologii. 1. vyd. Praha: Karolinum, 2004, 239 s. ISBN 8024607956. info
- Metody hodnocení
- přednášky, praktická cvičení;
ústní zkouška - Navazující předměty
- Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden. - Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
- Statistika zápisu (podzim 2010 - akreditace, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2010-akreditace/Bi7900