PřF:Bi8190 Vizualizace dat v R - Informace o předmětu
Bi8190 Manipulace a vizualizace dat v R
Přírodovědecká fakultapodzim 2024
- Rozsah
- 0/2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučováno kontaktně - Vyučující
- Mgr. Irena Axmanová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Bc. Klára Klinkovská (cvičící) - Garance
- Mgr. Irena Axmanová, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Irena Axmanová, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta - Předpoklady
- Bi7560 Úvod do R ||SOUHLAS
Předpokladem pro bezproblémový průchod kurzem je základní znalost práce v R, ideálně absolvování Úvodu do R Bi7560 Úvod do R před tímto kurzem. - Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- Biosystematika rostlin (program PřF, N-BOT)
- Ekologická a evoluční biologie (program PřF, B-EKB)
- Ekologie rostlin (program PřF, N-BOT)
- Fykologie a mykologie (program PřF, N-BOT)
- Ochrana přírody - botanika (program PřF, N-OCH)
- Ochrana přírody - zoologie (program PřF, N-OCH)
- Zoologie (program PřF, N-ZOL)
- Cíle předmětu
- V průběhu kurzu představíme pokročilé metody manipulace a vizualizace dat v programu R, zejména s využitím knihoven z kolekce tidyverse (tidyr, dplyr, tibble, purr, stringr, ggplot2, readr). Cílem předmětu je naučit studenty rutinní manipulaci s daty, tak aby si je uměli importovat, upravit, filtrovat, připojit nové informace z externích dat, vytvořit nové proměnné (např. na základě výpočtu), seskupit vzorky na základě nějaké charakteristiky/informace a pro tyto skupiny vypočítat další parametry. Dále se studenti naučí základní i pokročilé metody vizualizace dat pomocí ggplot2 a tvorbu základních map v R. Cílem předmětu je i osvojení přístupu open data science, kdy se naučí připravit skript tak, aby bylo možné ho na závěr publikovat na platformě GitHub.
- Literatura
- doporučená literatura
- WICKHAM, Hadley, Mine ÇETINKAYA-RUNDEL a Garrett GROLEMUND. R for data science : import, tidy, transform, visualize, and model data. 2nd edition. Tokyo: O'Reilly, 2023, xxiii, 548. ISBN 9781492097402. info
- WICKHAM, Hadley a Carson SIEVERT. Ggplot2 : elegant graphics for data analysis. Second edition. Switzerland: Springer, 2016, xvi, 260. ISBN 9783319242750. info
- Navazující předměty
- Informace učitele
- Předmět bude nově otevřený na podzim 2025 v aktualizované podobě. Podrobnosti doplníme.
- Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
- Statistika zápisu (nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2024/Bi8190