Bioinformatika

Program je určen pro studenty, kteří chtějí získat základní aplikované znalosti v  mezioborové oblasti bioinformatiky, tj. seznámit se s podstatou a povahou biologických a biochemických informací a naučit se efektivně vytvářet a používat vhodné informační technologie pro řešení problémů souvisejících se zpracováním a analýzou biologických hypotéz a souvisejících experimentálních dat. Vyjma základní orientace v mezioborové problematice získají posluchači znalosti a praktické dovednosti, které mohou použít bezprostředně po nástupu do praxe. V rámci povinně volitelných předmětů nabízí studijní program možnost zaměření studia na vybrané specializované oblasti bioinformatiky a výpočetní systémové biologie, jako jsou například modely komplexních biologických procesů, zpracování a analýza biologických sekvencí nebo počítačové modelování molekulárních struktur.

Absolvent je po úspěšném ukončení studia schopen:

• vysvětlit pojmy, metody a paradigmata bioinformatiky včetně relevantních matematických prostředků
• orientovat se v základních typech sekvencí biomakromolekul a struktur organických molekul i biomakromolekul
• navrhovat algoritmická řešení problémů a ve zvoleném jazyce zapsat efektivní program pro řešení daného problému
• rozumět základním principům IT a umět s nimi pracovat
• umět využít specifické bioinformatické nástroje a platformy a vytvářet komplexní bioinformatická workflow
• aplikovat různé metody ke zpracování, vizualizaci a analýze komplexních bioinformatických dat
• orientovat se v základních principech modelování biochemických struktur a biologických systémů
• umět efektivně využít a adaptovat algoritmy pro analýzu biologických sekvencí

Absolventi mohou po ukončení studijního programu nastoupit do praxe jako absolventi bakalářského programu s možností zvyšování kvalifikace a prohloubení konkrétních profesních znalostí realizované podle potřeb zaměstnavatele. Očekávanou možností je pokračování v navazujícím magisterském programu Bioinformatika, který je organizován Přírodovědeckou fakultou ve spolupráci s Fakultou informatiky a tím získat hlubší znalosti a dovednosti v některé z mezioborových specializací programu. Další možností je pokračování ve studiu v některém z vhodných magisterských programů jiného zaměření vyučovaných na Přírodovědecké fakultě nebo Fakultě informatiky.

Bakalářské a magisterské studium probíhá podle celouniverzitního kreditního systému, který je v souladu s pravidly European Credit Transfer System (ECTS). Povinně volitelné předměty jsou ve studijním plánu organizovány do jedné čí více skupin; student volí povinně volitelné předměty na základě stanoveného minimálního počtu kreditů v každé skupině.

Celouniverzitní pravidla pro tvorbu studijních programů, která zpřesňují pravidla vymezená v metodice Národního akreditačního úřadu Doporučené postupy pro přípravu studijních programů, upravuje směrnice Masarykovy univeritzy č. 1/2024 Pravidla pro tvorbu studijních programů a programů celoživotního vzdělávání. Směrnice vymezuje šest typů studijních plánů a jejich použití a kombinace v jednotlivých typech studijních programů. Jedná se o

1. jednooborový studijní plán,
2. studijní plán se specializací,
3. hlavní studijní plán (maior),
4. vedlejší studijní plán (minor),
5. studijní plán ve spolupráci s jinou vysokou školou či jinou právnickou osobou,
6. studijní plán na dostudování (určen pouze pro dostudování ve studijním oboru, studijním programu nebo studijním plánu, který zanikne).

Premisou pravidel je, že studijní plány umožňují naplnění cílů studia a dosažení profilu absolventa studijního programu. Výjimkou je pouze vedlejší studijní plán, který doplňuje hlavní studijního plán jiného studijního programu. Student nemůže studovat pouze podle vedlejšího studijního plánu.

Praxe není povinnou součástí bakalářského programu.

U bakalářské práce se očekává, že student především prokáže schopnost zpracovat větší projekt (například vytvořit užitečný program pro řešení konkrétního bioinformatického problému) a že dokáže své dílo zasadit do relevantního kontextu aktuálního poznání a prezentovat je formou odborného textu. Práce může být v českém, slovenském nebo anglickém jazyce. Předepsaná struktura práce zahrnuje sekce Kopie prohlášení autora školního díla, Prohlášení o autorství, Obsah, Vlastní text práce, a referencovanou literaturu. Minimální očekávaný rozsah práce je 30 normostran vlastního textu (včetně ilustrací).

Absolvent může pokračovat studiem navazujícího mezioborového magisterského programu Bioinformatika organizovaného Přírodovědeckou fakultou ve spolupráci s Fakultou informatiky. Absolvent může rovněž pokračovat (po splnění podmínek přijetí) ve studiu dalšího vhodného navazujícího magisterského programu vyučovaného na Fakultě informatiky nebo Přírodovědecké fakultě.