bakalářský prezenční jednooborový, vyučovací jazyk: čeština
Zahrnut v programu: FI B-BIO Bioinformatika
Úvodní informace / Pokyny
Společný univerzitní základ (15 kr.)
K úspěšnému zakončení studia student v bakalářských studijních programech získá 15 kr. z předmětů tzv. Společného univerzitního základu. Mezi tyto kredity se počítají 2 kredity z předmětů sportovních aktivit (TV), 4 kredity za cizí jazyk, a 9 kreditů za předměty společensko-vědního či přírodovědného základu – tzv. CORE předmětů.
Společensko-vědní a přírodovědný základ
Získat alespoň 9 kreditů z libovolných předmětů CORE.
Jazyky
Povinně absolvovat VB001. Povinně volba VB035 a VB036, nebo VV064.
TV
Získat minimálně 2 kredity za tělesnou výchovu.
Bakalářská práce (min. 10 kr)
Povinnost získat 10 kreditů z předmětu SBAPR.
| Kód | Název | Ukončení | Kreditů | Semestr | Profilace |
| FI:SBAPR | Bakalářská práce | z | 10 | - | - |
| 10 kreditů |
Povinné předměty (P+PV více než 135kr.)
Absolvovat všechny povinné a vybrané povinně volitelné předměty nejvyšší formou ukončení.
| Kód | Název | Ukončení | Kreditů | Semestr | Profilace |
| PřF:Bi4020 | Molekulární biologie | zk | 3+2 | 4 | P |
| PřF:C2131 | Úvod do bioinformatiky | zk | 2+2 | 2 | Z |
| PřF:C2132 | Úvod do bioinformatiky - seminář | z | 1 | 2 | - |
| PřF:C2133 | Úvod do chemoinformatiky | zk | 2+2 | 3 | P |
| PřF:C2144 | Python pro bioinformatiky | zk | 6 | 2 | - |
| PřF:C3180 | Biochemie I - seminář | z | 2 | 1 | - |
| PřF:C3181 | Biochemie I | zk | 2+2 | 1 | Z |
| PřF:C3210 | Strukturní bioinformatika | zk | 1+2 | 5 | P |
| FI:IB000 | Matematické základy informatiky | z | 4 | 1 | - |
| FI:IB113 | Úvod do programování a algoritmizace | zk | 4+2 | 1 | Z |
| FI:IV107 | Bioinformatika I | zk | 2+2 | 3 | Z |
| FI:IV109 | Modelování a simulace | zk | 3+2 | 4 | - |
| FI:IV114 | Projekt z bioinformatiky a systémové biologie | k | 2+1 | 4 | - |
| FI:MB141 | Lineární algebra a diskrétní matematika | zk | 3+2 | 2 | Z |
| FI:MB142 | Aplikovaná matematická analýza | zk | 3+2 | 3 | Z |
| FI:MB143 | Návrh a analýza statistických experimentů | zk | 3+2 | 4 | Z |
| FI:PA052 | Úvod do systémové biologie | zk | 2+2 | 1 | P |
| FI:PA055 | Vizualizace bioinformatických dat | zk | 2+2 | 3 | P |
| FI:PB001 | Úvod do informačních technologií | zk | 2+2 | 1 | Z |
| FI:PB007 | Software Engineering I | zk | 3+2 | 5 | P |
| FI:PB050 | Modelování a predikce v systémové biologii | zk | 2+2 | 5 | P |
| FI:PB051 | Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii | zk | 2+2 | 2 | P |
| FI:PB153 | Operační systémy a jejich rozhraní | zk | 2+2 | 4 | - |
| FI:PB168 | Základy databázových a informačních systémů | zk | 3+2 | 3 | P |
| FI:PB176 | Základy kvality a správy kódu | k | 3+1 | 6 | - |
| FI:PV225 | Laboratoř systémové biologie | k | 3+1 | 3 | - |
| FI:SBPrip | Opakování před SBZZ | z | 1 | 6 | - |
| FI:SOBHA | Obhajoba závěrečné práce | SZk | - | 6 | - |
| FI:SZB | Státní zkouška (bakalářský studijní program) | SZk | - | 6 | - |
| 109 kreditů |
Povinně-volitelné předměty
Povinně splnit podmínky bloků níže a alespoň jednoho bloku zaměření.
Návrh algoritmů
Absolvovat jeden z předmětů bloku. Předmět C2142 je doporučen přírodovědně zaměřeným studentům bez předchozích vlastních zkušeností s programováním.
Práce s operačním systémem UNIX
Absolvovat jeden z předmětů. Předmět C2110 je doporučen studentům, kteří se s unixovým systémem dosud nesetkali.
Akademické psaní
Absolvovat alespoň 1 předmět z bloku.
| Kód | Název | Ukončení | Kreditů | Semestr | Profilace |
| FI:PB029 | Elektronická příprava dokumentů | zk | 3+2 | - | - |
| FI:VB000 | Základy odborného stylu | k | 2+1 | 3 | - |
| FI:VB000Eng | Introduction to Academic Writing | k | 2+1 | - | - |
| 11 kreditů |
Právní a etické aspekty
Abslovovat alespoň 1 z předmětů.
Zaměření Aplikovaná bioinformatika
Absolvovat všechny předměty vybraného zaměření.
| Kód | Název | Ukončení | Kreditů | Semestr | Profilace |
| PřF:C9530 | Strukturní biochemie | zk | 2+2 | 5 | - |
| PřF:C9531 | Strukturní biochemie - seminář | z | 2 | 5 | - |
| PřF:C2135 | Bioinformatika v praxi | k | 2+1 | 6 | - |
| PřF:C2150 | Zpracování informací a vizualizace v chemii a biochemii | k | 2+1 | 6 | - |
| PřF:C2145 | Strukturní bioinformatika v praxi | k | 3 | 5 | - |
| PřF:C7170 | Struktura a funkce buňky | zk | 4 | 3 | - |
| PřF:C9088 | RNA a DNA sekvenční analýza | zk | 2+2 | 6 | - |
| 23 kreditů |
Zaměření Vývoj bioinformatického software
Absolvovat všechny uvedené předměty vybraného zaměření a předměty bloku volby dle instrukcí níže.
Absolvovat alespoň 2 z předmětů níže nejvyšším způsobem ukončení.
Získat alespoň 3 kredity.
Volitelné předměty
Absolvovat další předměty dle vlastní volby tak, aby celkový zisk kreditů byl minimálně 180.