Bi5599 Applied Chemistry and Biochemistry

Faculty of Science
Autumn 2007 - for the purpose of the accreditation
Extent and Intensity
2/0. 2 credit(s) (plus extra credits for completion). Type of Completion: graded credit.
Teacher(s)
prof. RNDr. Jan Vondráček, Ph.D. (lecturer)
RNDr. Miroslav Machala, CSc. (lecturer), MVDr. Mgr. Monika Dušková, Ph.D. (deputy)
Guaranteed by
prof. RNDr. Alois Kozubík, CSc.
Department of Experimental Biology – Biology Section – Faculty of Science
Contact Person: prof. RNDr. Jan Vondráček, Ph.D.
Prerequisites (in Czech)
Bi4020 Molecular biology && C3580 Biochemistry
Course Enrolment Limitations
The course is offered to students of any study field.
Course objectives (in Czech)
Během přednášek kursu jsou studenti seznámeni s přehledem základní metodiky analýzy makromolekul a práce s nimi (DNA, RNA, proteiny, lipidy), dále s technikami práce s nízkomolekulárními látkami, analýzou buněčných populací a subbuněčných struktur, a základními principy in vivo experimentů. Předmět je prezentován formou přednášky a částečně semináře zaměřeného především na práci s literaturou, s cílem pochopit význam jednotlivých metodik a interpretovat výsledky z publikací i vlastní experimentální činnosti. Aktivní účast studentů je podmínkou.
Syllabus
  • 1)Protein analysis; separation techniques; Western blotting, protein-protein interactions; protein localization; protein post-translational modifications; proteomics; manipulations of protein expression. 2)Basic immunochemistry techniques. 3)DNA isolation, separation; PCR techniques, plasmid work, transfection of eukaryotic cells. 4)RNA isolation, detection (Northern blotting, RT-PCR), microarrays, siRNA. 5)Lipids and polysacharidy; isolation, separation and identification. 6)Low-molecular-weight compounds - separation and analytical techniques; HPLC techniques and their modifications. 7)Specific cellular assays. 8)Fluorescennce techniques. 9)Aplication of in vivo mammalian models in physiology.
Assessment methods (in Czech)
Kolokvium. Ukončení je provedeno formou referátu o metodických přístupech využitých v zadané vědecké publikaci (separátu).
Language of instruction
Czech
Listed among pre-requisites of other courses
The course is also listed under the following terms Autumn 2010 - only for the accreditation, Autumn 2004, Autumn 2005, Autumn 2006, Autumn 2007, Autumn 2008, Autumn 2009, Autumn 2010, Autumn 2011, Autumn 2011 - acreditation, Autumn 2012, Autumn 2013, Autumn 2014, Autumn 2015, Autumn 2016, autumn 2017, Autumn 2018, Autumn 2019, Autumn 2020, autumn 2021, Autumn 2022, Autumn 2023, Autumn 2024.