PřF:Bi3307 Trends in shape analysis - Course Information
Bi3307 Actual trends in shape and image analysis in anthropology
Faculty of ScienceSpring 2008
- Extent and Intensity
- 0/2/0. 2 credit(s). Type of Completion: z (credit).
- Teacher(s)
- doc. RNDr. Miroslav Králík, Ph.D. (seminar tutor)
- Guaranteed by
- doc. RNDr. Miroslav Králík, Ph.D.
Department of Anthropology – Biology Section – Faculty of Science
Contact Person: doc. RNDr. Miroslav Králík, Ph.D. - Course Enrolment Limitations
- The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
The capacity limit for the course is 8 student(s).
Current registration and enrolment status: enrolled: 0/8, only registered: 0/8, only registered with preference (fields directly associated with the programme): 0/8 - fields of study / plans the course is directly associated with
- Anthropology (programme PřF, D-BI)
- Course objectives (in Czech)
- Předmět je zaměřen na praktické procvičení práce s 2D a 3D digitizérem (tpsDig, MicroScribe), software pro analýzu obrazu (SigmaScan) a programy pro analýzu tvaru (TPS, Morphologica, Shape, EFAWin).
- Syllabus (in Czech)
- 1. Historie a přehled současných prostředků morfometrie v antropologii. 2. Digitalizace kostí a částí těla živého člověka do formy kartézských souřadnic význačných bodů a křivek pomocí 2D a 3D digitizérů. 3. Analýza tvaru metodami geometrické morfometrie (Prokrustova superimpozice, Thin Plate Spline, Partial Warps, Eliptická Fourierova analýza), vizualizace a hodnocení tvarových rozdílů. 4. Možnosti a současné trendy histomorfometrie a kosterní antropologie. Praktické cvičení histomorfometrických metod na kostech a zubech pro rozpoznání biologického původu kosti a pro odhad dožitého věku jedince: konvenční metrické postupy (délkové míry, indexy, obsahy atd.). 5. Nástin možností aplikace pokročilých metod: (Eliptická Fourierova analýza, Eigenshape analysis, wavelet analysis.)
- Literature
- Software: TPS, Rhinoceros, Morphologica, EFAWin, Shape, SigmaScan, Statistica, Photoshop, Photopaint, Past.
- Bookstein, F. L. (1991): Morphometric tools for landmark data: geometry and biology. Cambridge Univ. Press: New York.
- Zelditch, M. L., D. L. Swiderski, H. D. Sheets, and W. L. Fink. (2004): Geometric Morphometrics for biologists: a primer. Elsevier Academic Press: London.
- Kilian J., Šídlo R., Merglová V. (1981): K problematice určování stáří jedince podle chrupu. Soudní lékařství 26: 33-42, 49-54, 55-59.
- URBANOVÁ, Petra and Vladimír NOVOTNÝ. Distinguishing between Human and Non-human bones: Histometric metod for forensic antropology. Anthropologie. 2005, XLIII, No 1, p. 77-85, 8 pp. ISSN 0323-1119. info
- VYSTRČILOVÁ, Michaela and Vladimír NOVOTNÝ. Estimation of age at death using teeth. Variability and Evolution. Poznań: Adam Mickiewicz University, Faculty of Biology, Institute of Anthropology, 2000, No 8, p. 39-49. ISSN 0860-7907. info
- Kuhl, F.P. - Giardina, C.R. (1982): Elliptic Fourier Features of a Closed Contour. Computer Graphics and Image Processing 18: 236 - 258.
- Iwata, H. - Ukai, Y. (2002): SHAPE: A Computer Program Package for Quantitative Evaluation of Biological Shapes Based on Elliptic Fourier Descriptors. The Journal of Heredity 93: 384 - 385.
- Lestrel, P. E. - Cesar - Jr., R. M. - Takahashi, O. - Kanazawa, E. (2004): A Fourier-wavelet representation of 2-D-shapes: sexual dimorphism in the Japanese cranial base. Anthropological Science 112/1: 3 - 28.
- Assessment methods (in Czech)
- Blokové cvičení pro omezený počet vážných zájemců z řad DSP studentů antropologie, ve výjimečných případech i z jiných oborů (po předchozí domluvě). Počet účastníků je omezen technickým vybavením. Ukončení zápočtem po diskusi nad laboratorním protokolem.
- Language of instruction
- Czech
- Further Comments
- The course is taught annually.
The course is taught: in blocks.
- Enrolment Statistics (Spring 2008, recent)
- Permalink: https://is.muni.cz/course/sci/spring2008/Bi3307