PřF:CB070 Proteinová krystalografie - Informace o předmětu
CB070 Proteinová krystalografie
Přírodovědecká fakultapodzim 2021
- Rozsah
- 1/0/0. 1 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
- Vyučující
- doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D. (přednášející) - Garance
- doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D.
Ústav chemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav chemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta - Rozvrh
- Út 12:00–12:50 C04/211
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 12 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Cílem výuky je vysvětlit studentům základní principy monokrystalové rtg. strukturní analýzy, uvést je do kinematické teorie monokrystalové difrakce a seznámit je s přístroj. výbavou používanou při difrakčním experimentu a metodami pro vyhodnocování experimentálních RTG dat. Na předmět CB070 navazuje cvičení CB080.
- Výstupy z učení
- Na konci tohoto kurzu student bude: - schopen porozumět a vysvětlit principy monokrystalové rtg. strukturní analýzy - seznámen se stručnou historií rtg. krystalografie - seznámen s přístrojovou instrumentací rtg. krystalografie - znát základní postupy rtg. krystalografie - seznámen s praktickými příklady
- Osnova
- Symetrie látek. Interakce rtg. záření s látkou
- Difrakce na krystalu
- Zdroje a detektory rtg. záření, Difraktometry
- Fázový problém
- Pattersonovské a přímé metody
- Upřesňování modelu, R-faktory, metoda nejmenších čtverců.
- Programy SHELXS a SHELXL, CNS a CCP4
- Příprava proteinových krystalů
- Proteiny a metody kovových derivátů
- Molekulární nahrazení
- Upřesňování proteinových strukturních modelů
- Krystalografické databáze
- Literatura
- MAREK, Jaromír a Z. TRÁVNÍČEK. Monokrystalová rentgenová strukturní analýza. první. Olomouc: Vydavatelství Univerzity Palackého, 2002, 169 s. nedělí se na edice. ISBN 80-244-0551-2. info
- GIACOVAZZO, C. Fundamentals of Crystallography. 1992. ISBN 0-19-855578-4. info
- Výukové metody
- Teoretická příprava. Domácí práce prováděná na počítači.
- Metody hodnocení
- Zkouška - ústní. Domácí práce prováděná na počítači.
- Další komentáře
- Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně. - Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
- Statistika zápisu (podzim 2021, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2021/CB070