Řazení po semestrech Klasické řazení Prezentace
FI BIN Bioinformatika
Název anglicky: Bioinformatics
bakalářský prezenční jednooborový, vyučovací jazyk: čeština čeština
Zahrnut v programu: FI B-BIO Bioinformatika

Informace o studiu

SbalitRozbalit
  • Součásti SZZ a jejich obsah
    Státní závěrečná zkouška (SZZ) sestává ze dvou odděleně klasifikovaných součástí:
    obhajoby bakalářské práce a odborné závěrečné zkoušky. Celá státni zkouška trvá zhruba půl hodiny (přibližně 15 minut obhajoba, 15 minut zkoušení). Na prezentaci bakalářské práce má student zhruba 8 minut. poté probíhá rozbor posudků a diskuze. V následující ústní závěrečné zkoušce student odpovídá na dvě položené otázky kladené zkoušejícími členy komise SZZ. Přičemž platí, že jedna otázka je kladena ze společného základu oblasti informatiky (programování a počítačové technologie) a jedna otázka z profilujících bioinformatických předmětů programu (technologické základy bioinformatiky).
    Pro úspěšné složení závěrečné zkoušky musí student být schopen vysvětlit základní pojmy s nimiž se seznámil v profilujících předmětech studijního programu, musí demonstrovat schopnost použití základních technik, metod a pojmů vysvětlených v profilujících předmětech programu a musí být schopen reagovat na relevantní doplňující otázky, případně, vybrané téma rozvinout mírně do hloubky. Pokud student není schopen dostát některému z těchto požadavků, je hodnocen stupněm nevyhovující.
    Podmínkou přístupu k závěrečné zkoušce je odevzdání bakalářské práce. V případě negativních posudků na bakalářskou práci se student může vzdát obhajoby, akceptovat hodnocení „nevyhověl" a přejít rovnou ke zkoušení. V případě neúspěšné obhajoby není možné odstoupit od zkoušení.
  • Návrh témat kvalifikačních prací a témata obhájených prací
    Příklady témat závěrečných prací (práce obhájené v minulosti v souvisejících programech, které tento program nahrazuje):

    1) Unique Molecular Identifiers Handling Tools Benchmarking, https://is.muni.cz/th/ai1bs/
    2) Optimalizace programu TE-nester pro vyhledávání fragmentovaných transpozonů, https://is.muni.cz/th/zkmv6/
    3) Empirické metody pro výpočet parciálních atomových nábojů, https://is.muni.cz/th/ts2kg/
    4) Formal representation of graphical models of biological systems, https://is.muni.cz/th/nm01y/
    5) Vizualizace proteinových rodin pomocí 2D diagramů, https://is.muni.cz/th/shs14/
SbalitRozbalit

Doporučený průchod studijním plánem

Společný univerzitní základ (15 kr.)

K úspěšnému zakončení studia student v bakalářských studijních programech získá 15 kr. z předmětů tzv. Společného univerzitního základu. Mezi tyto kredity se počítají 2 kredity z předmětů sportovních aktivit (TV), 4 kredity za cizí jazyk, a 9 kreditů za předměty společensko-vědního či přírodovědného základu – tzv. CORE předmětů.

Společensko-vědní a přírodovědný základ

Získat alespoň 9 kreditů z libovolných předmětů CORE.

Jazyky

Povinně absolvovat VB001. Povinně volba VB035 a VB036, nebo VV064.

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
FI:VB001English Exam E. Rudolfovázk 0/0/01 2-
FI:VB035English Skills for IT I E. Rudolfováz 0/2/01 1-
FI:VB036English Skills for IT II E. Rudolfováz 0/2/02 2-
FI:VV064Academic and Professional Skills in English for IT E. Rudolfovázk 0/2/02+2 --
8 kreditů

TV

Získat minimálně 2 kredity za tělesnou výchovu.

Bakalářská práce (min. 10 kr)

Povinnost získat 10 kreditů z předmětu SBAPR.

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
FI:SBAPRBakalářská práce D. Svobodaz 0/0/010 --
10 kreditů

Povinné předměty (P+PV více než 135kr.)

Absolvovat všechny povinné a vybrané povinně volitelné předměty nejvyšší formou ukončení.

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
PřF:Bi4020Molekulární biologie J. Šmardazk 3/0/03+2 4P
PřF:C2131Úvod do bioinformatiky M. Wimmerovázk 2/0/02+2 2Z
PřF:C2132Úvod do bioinformatiky - seminář M. Wimmerováz 0/1/01 2-
PřF:C2133Úvod do chemoinformatiky R. Svobodovázk 2/0/02+2 3P
PřF:C2144Python pro bioinformatiky T. Račekzk 1/2/16 2-
PřF:C3180Biochemie I - seminář Z. Farkaz 0/2/02 1-
PřF:C3181Biochemie I P. Skládalzk 2/0/02+2 1Z
PřF:C3210Strukturní bioinformatika M. Wimmerovázk 1/0/01+2 5P
FI:IB000Matematické základy informatiky P. Hliněnýz 2/2/14 1-
FI:IB113Úvod do programování a algoritmizace R. Pelánekzk 2/2/14+2 1Z
FI:IV107Bioinformatika I M. Lexazk 2/1/02+2 3Z
FI:IV109Modelování a simulace R. Pelánekzk 2/1/03+2 4-
FI:IV114Projekt z bioinformatiky a systémové biologie M. Lexak 0/1/12+1 4-
FI:MB141Lineární algebra a diskrétní matematika D. Krumlzk 2/2/03+2 2Z
FI:MB142Aplikovaná matematická analýza M. Veselýzk 2/2/03+2 3Z
FI:MB143Návrh a analýza statistických experimentů D. Krauszk 2/2/03+2 4Z
FI:PA052Úvod do systémové biologie L. Brimzk 2/0/02+2 1P
FI:PA055Vizualizace bioinformatických dat M. Lexazk 1/12+2 3P
FI:PB001Úvod do informačních technologií L. Matyskazk 2/0/02+2 1Z
FI:PB007Software Engineering I B. Bühnovázk 2/2/03+2 5P
FI:PB050Modelování a predikce v systémové biologii D. Šafránekzk 1/1/02+2 5P
FI:PB051Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii M. Lexazk 1/1/02+2 2P
FI:PB153Operační systémy a jejich rozhraní J. Ráčekzk 2/0/02+2 4-
FI:PB168Základy databázových a informačních systémů V. Dohnalzk 2/2/03+2 3P
FI:PB176Základy kvality a správy kódu L. Ručkak 2/0/13+1 6-
FI:PV225Laboratoř systémové biologie D. Šafránekk 1/2/03+1 3-
FI:SBPripOpakování před SBZZ J. Barnatz 0/0/11 6-
FI:SOBHAObhajoba závěrečné práce D. SvobodaSZk 0/0/0- 6-
FI:SZBStátní zkouška (bakalářský studijní program) D. SvobodaSZk 0/0/0- 6-
109 kreditů

Povinně-volitelné předměty

Povinně splnit podmínky bloků níže a alespoň jednoho bloku zaměření.

Návrh algoritmů

Absolvovat jeden z předmětů bloku. Předmět C2142 je doporučen přírodovědně zaměřeným studentům bez předchozích vlastních zkušeností s programováním.

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
PřF:C2142Návrh algoritmů pro přírodovědce T. Račekzk 1/2/03+2 2-
FI:IB114Úvod do programování a algoritmizace II I. Černázk 2/1/03+2 2-
10 kreditů

Práce s operačním systémem UNIX

Absolvovat jeden z předmětů. Předmět C2110 je doporučen studentům, kteří se s unixovým systémem dosud nesetkali.

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
PřF:C2110Operační systém UNIX a základy programování P. Kulhánekk 0/2/02+1 2-
FI:PV004UNIX M. Brandejsk 2/0/02+1 2-
6 kreditů

Akademické psaní

Absolvovat alespoň 1 předmět z bloku.

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
FI:PB029Elektronická příprava dokumentů P. Sojkazk 2/1/03+2 --
FI:VB000Základy odborného stylu Z. Nevěřilovák 1/1/02+1 3-
FI:VB000EngIntroduction to Academic Writing E. Rudolfovák 1/1/02+1 --
11 kreditů

Právní a etické aspekty

Abslovovat alespoň 1 z předmětů.

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
FI:PV119Základy práva pro informatiky D. Šmídovázk 2/0/02+2 --
FI:VV076Etika a informační technologie T. Foltýnekk 2/0/02+1 --
7 kreditů

Zaměření Aplikovaná bioinformatika

Absolvovat všechny předměty vybraného zaměření.

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
PřF:C9530Strukturní biochemie L. Žídekzk 2/0/02+2 5-
PřF:C9531Strukturní biochemie - seminář L. Žídekz 0/2/02 5-
PřF:C2135Bioinformatika v praxi L. Malinovskák 0/2/02+1 6-
PřF:C2150Zpracování informací a vizualizace v chemii a biochemii P. Kulhánekk 0/2/02+1 6-
PřF:C2145Strukturní bioinformatika v praxi R. Svobodovák 0/1/13 5-
PřF:C7170Struktura a funkce buňky O. Šerýzk 2/0/04 3-
PřF:C9088RNA a DNA sekvenční analýza R. Svobodovázk 1/1/02+2 6-
23 kreditů

Zaměření Vývoj bioinformatického software

Absolvovat všechny uvedené předměty vybraného zaměření a předměty bloku volby dle instrukcí níže.

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
FI:PB112Základy objektově orientovaného programování v jazyce Java T. Pitnerzk 2/2/03+2 4-
FI:PB138Základy webového vývoje a značkovacích jazyků T. Pitnerzk 2/2/03+2 6-
10 kreditů
volba ve výpočetních metodách

Absolvovat alespoň 2 z předmětů níže nejvyšším způsobem ukončení.

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
FI:IB031Úvod do strojového učení T. Brázdilzk 2/2/03+2 6-
FI:PB016Úvod do umělé inteligence A. Horákzk 2/2/03+2 5-
FI:MA018Numerical Methods J. Zelinkazk 2/2/03+2 5-
15 kreditů
volba v počítačových technologiích

Získat alespoň 3 kredity.

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
FI:PV003Architektura relačních databázových systémů M. Batkozk 2/1/03+2 4-
FI:PV005Služby počítačových sítí M. Brandejsz 2/0/02 5-
FI:PA039Supercomputer Architecture and Intensive Computations L. Matyskazk 2/0/02+2 6-
11 kreditů

Volitelné předměty

Absolvovat další předměty dle vlastní volby tak, aby celkový zisk kreditů byl minimálně 180.