Bi7311 Praktikum z molekulární biologie prokaryot

Přírodovědecká fakulta
podzim 2009
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Předpoklady
( B2050 Obecná mikrobiologie || Bi2050c Zákl. obecné mikrobiologie cv. || B4070 Obecná mikrobiologie || B4090 Obecná mikrobiologie || Bi4090c Obecná mikrobiologie - cv. ) && NOW( Bi7120 Molekulární biologie prokaryot )
Předpokladem je absolvování přednášky z molekulární biologie prokaryot, praktické úlohy vyžadují znalost mikrobiologických technik.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem pragtika je absolvování základních molekulárně biologických metod používaných pro analýzu prokaryotického genomu a metod z genetiky bakterií.
Osnova
  • 1. Pulzní gelová elektroforéza (PFGE) genomové DNA baktérií.
  • Izolace DNA pro PFGE, příprava vzorků, štěpení vzorků restrikční endonukleázou SmaI, příprava gelu, výpočet parametrů pro pulzní elektroforézu. Analýza polymorfizmů v makrorestrikčním spektru.
  • 2. Izolace spontánních mutant Staphylococcus aureus rezistentních k antibiotikům metodou gradientních ploten.
  • 3. Fluktuační test a stanovení mutační rychlosti.
  • 4. Konjugace E. coli.
  • 5. Izolace auxotrofních mutant. Razítkování kolonií.
  • 6. Typizační techniky pro epidemiologické a fylogenetické účely, AP-PCR, RFLP.
Literatura
  • MILLER, Jeffrey H. A Short course in bacterial genetics : a laboratory manual and handbook for Escherichia coli and related bacteria. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1992, 456 s. ISBN 0879693495. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá blokově, ve výzkumných laboratořích oddělení genetiky a molekulární biologie. Studenti provádějí praktické úlohy podle tištěných návodů a instrukcí vyučujících.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech úloh, zápočtového testu a odevzdání protokolů.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, podzim 2010 - akreditace, podzim 2002, podzim 2003, podzim 2004, podzim 2005, podzim 2006, podzim 2007, podzim 2008, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023, podzim 2024.