Bi7311 Praktikum z molekulární biologie prokaryot

Přírodovědecká fakulta
podzim 2014
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Marian Varga, Ph.D. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
Bi7311/01: Út 13:00–13:50 E25/209, Út 13:00–16:50 E25/119, R. Pantůček, V. Růžičková
Bi7311/02: St 8:00–8:50 E25/209, St 8:00–11:50 E25/119, R. Pantůček, V. Růžičková
Předpoklady
( B2050 Obecná mikrobiologie || Bi2050c Zákl. obecné mikrobiologie cv. || B4070 Obecná mikrobiologie || B4090 Obecná mikrobiologie || Bi4090c Obecná mikrobiologie - cv. ) && NOW( Bi7120 Molekulární biologie prokaryot )
Předpokladem je absolvování přednášky z molekulární biologie prokaryot, praktické úlohy vyžadují znalost mikrobiologických technik.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 32 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/32, pouze zareg.: 0/32
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem pragtika je absolvování základních molekulárně biologických metod používaných pro analýzu prokaryotického genomu a metod z genetiky bakterií.
Osnova
  • 1. Pulzní gelová elektroforéza (PFGE) genomové DNA baktérií.
  • Izolace DNA pro PFGE, příprava vzorků, štěpení vzorků restrikční endonukleázou SmaI, příprava gelu, výpočet parametrů pro pulzní elektroforézu. Analýza polymorfizmů v makrorestrikčním spektru.
  • 2. Izolace spontánních mutant Staphylococcus aureus rezistentních k antibiotikům metodou gradientních ploten.
  • 3. Fluktuační test a stanovení mutační rychlosti.
  • 4. Konjugace E. coli.
  • 5. Izolace auxotrofních mutant. Razítkování kolonií.
  • 6. Typizační techniky pro epidemiologické a fylogenetické účely, AP-PCR, RFLP.
Literatura
  • MILLER, Jeffrey H. A Short course in bacterial genetics : a laboratory manual and handbook for Escherichia coli and related bacteria. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1992, 456 s. ISBN 0879693495. info
  • ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
Výukové metody
Výuka probíhá polovinu semestru v dvojnásobné hodinové dotaci, ve výzkumných laboratořích oddělení genetiky a molekulární biologie. Studenti provádějí praktické úlohy podle tištěných návodů a instrukcí vyučujících.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech úloh, zápočtového testu a odevzdání protokolů.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, podzim 2010 - akreditace, podzim 2002, podzim 2003, podzim 2004, podzim 2005, podzim 2006, podzim 2007, podzim 2008, podzim 2009, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023, podzim 2024.