PřF:Bi7311 Prakt. z mol. biol. prokaryot - Informace o předmětu
Bi7311 Praktikum z molekulární biologie prokaryot
Přírodovědecká fakultapodzim 2019
- Rozsah
- 0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
- Vyučující
- Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Mgr. Adéla Finstrlová, Ph.D. (pomocník) - Garance
- Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta - Rozvrh
- Út 13:00–16:50 E25/119, Čt 8:00–9:50 E25/119
- Rozvrh seminárních/paralelních skupin:
Bi7311/Bi7311_2: Rozvrh nebyl do ISu vložen. A. Finstrlová, I. Mašlaňová, V. Růžičková - Předpoklady
- ( B2050 Obecná mikrobiologie || Bi2050c Zákl. obecné mikrobiologie cv. || B4070 Obecná mikrobiologie || B4090 Obecná mikrobiologie || Bi4090c Obecná mikrobiologie - cv. ) && NOW( Bi7120 Molekulární biologie prokaryot )
Předpokladem je absolvování přednášky z molekulární biologie prokaryot. Praktické úlohy vyžadují znalost mikrobiologických a základních molekulárních technik. - Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Předmět si smí zapsat nejvýše 32 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/32, pouze zareg.: 0/32 - Mateřské obory/plány
- předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Cílem praktika je osvojení základních molekulárně biologických metod používaných pro analýzu prokaryotického genomu, metod z genetiky bakterií a pochopení principů horizontálního přenosu genů. Studenti se seznámí s analýzami pro identifikaci změn v prokaryotických genomech vlivem mutací, horizontálního přenosu genů transdukcí, konjugací a transformací, což prakticky doplní náplň přednášek z Molekulární biologie prokaryot (Bi7120). Studenti pochopí mechanismy evoluce prokaryot v praxi a získají přehled o technikách využitelných k manipulaci bakteriálních genomů.
- Výstupy z učení
- Na konci kurzu budou studenti schopni navrhnout a provádět základní experimenty zaměřené na genetické studie modelových mikroorganismů E. coli a vybraných druhů grampozitivních koků.
- Osnova
- 1. Purifikace fágových částic pomocí ultracentrifugace v gradientu CsCl. Objektem bude stafylokokový bakteriofág phi812 s potenciálním využitím ve fágové terapii.
- 2. Transdukce. Přenos plazmidových genů rezistence prostřednictvím temperovaného bakteriofága. Temperovaný fág phiJB bude v rámci cvičení indukován pomocí UV záření. Připrava transdukujicího lyzátu, výpočet frekvence transdukce a ověření přenosu faktorů rezistence v populaci bakterií.
- 3. Stanovení počtu kopií plazmidů (PCN) pomocí qPCR.
- 4. Pulzní gelová elektroforéza.
- 5. Konjugace u kmenů E. coli.
- 6. Transformace plazmidové DNA pomocí elektroporace. Stanovení frekvence vzniku transformant.
- 7. Sledování exprese fágového endolyzinu. Izolace RNA, přepis RNA do cDNA, separace proteinů metodou SDS-PAGE.
- 8. Izolace spontálních mutant Staphylococcus aureus rezistentních k antibiotikům na gradientních plotnách.
- Literatura
- SNYDER, Larry a Wendy CHAMPNESS. Molecular genetics of bacteria. 2nd ed. Washington: ASM Press, 2003, xvi, 566. ISBN 155581204X. info
- MILLER, Jeffrey H. A Short course in bacterial genetics : a laboratory manual and handbook for Escherichia coli and related bacteria. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1992, 456 s. ISBN 0879693495. info
- ROSYPAL, Stanislav. Obecná bakteriologie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1981, 749 s. info
- Výukové metody
- Výuka probíhá polovinu semestru v dvojnásobné hodinové dotaci, ve výzkumných laboratořích oddělení genetiky a molekulární biologie. Studenti provádějí praktické úlohy podle tištěných návodů a instrukcí vyučujících.
- Metody hodnocení
- Pro získání zápočtu je nutné absolvování všech úloh, zápočtového testu a odevzdání protokolů.
- Navazující předměty
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
- Statistika zápisu (podzim 2019, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2019/Bi7311