PřF BIOMB Biomedicínská bioinformatika
Název anglicky: Biomedical bioinformatics
bakalářský prezenční se specializací, vyučovací jazyk: čeština čeština
Zahrnut v programu: PřF B-MBB Matematická biologie a biomedicína

Informace o studiu

  • Součásti SZZ a jejich obsah
    Bakalářská státní závěrečná zkouška se skládá ze čtyř částí, v případě prvních tří se jedná o písemnou zkoušku, v případě čtvrté pak o ústní obhajobu závěrečné práce:
    1. Biologie - tématické okruhy biologické části SZZ jsou zaměřeny na ověření znalostí z oblasti buněčné biologie, fyziologie, genetiky a molekulární biologie.
    2. Matematika a statistika - tématické okruhy matematické části SZZ jsou zaměřeny na ověření znalostí z oblasti matematické analýzy, lineární algebry, pravděpodobnosti a statistiky, vícerozměrných statistických metod a základních principů matematického modelování.
    3. Bioinformatika - specializační část SZZ je zaměřena na ověření znalostí z oblasti bioinformatiky a základních metod pro hodnocení a interpretaci dat z molekulárně biologických experimentů.
    4. Obhajoba bakalářské práce.
  • Návrh témat kvalifikačních prací a témata obhájených prací
    1. Barbora Zwinsová (2012): Studium exprese genů specifických pro BRAF mutantní nádory kolorekta napříč různými částmi tlustého střeva u časných stupňů vývoje karcinomu (https://is.muni.cz/auth/th/356955/prif_b/),
    2. Kamil Jaroň (2013): Genomické ostrovy v genomu plísně asociované se syndromem bílých nosů (https://is.muni.cz/auth/th/376090/prif_b/),
    3. Marta Surgentová (2013): Výpočetní analýza proteinových tunelů (https://is.muni.cz/auth/th/380406/prif_b/),
    4. Kristína Luermann (2014): Signál selekce v kódující sekvenci DNA (https://is.muni.cz/auth/th/393972/prif_b/),
    5. Tereza Hlubinková (2015): Vliv meziplatformové normalizace genových expresních dat na výkonnost genových expresních signatur (https://is.muni.cz/auth/th/408164/prif_b/).

Doporučený průchod studijním plánem

Společná část (90-120kr.)

Společný univerzitní základ (15 kr.)

K úspěšnému zakončení studia student v bakalářských studijních programech získá 15 kr. z předmětů tzv. Společného univerzitního základu. Mezi tyto kredity se počítají 2 kredity z předmětů sportovních aktivit (TV), 4 kredity za cizí jazyk, a 9 kreditů za předměty společensko-vědního či přírodovědného základu – tzv. CORE předmětů. Aktuální nabídka CORE předmětů je k dispozici zde: https://www.muni.cz/studenti/spolecny-univerzitni-zaklad

Společensko-vědní a přírodovědný základ

Student povinně zapisuje předměty v minimální celkové hodnotě 9 kreditů za celé bakalářské studium ze základní nabídky Společného univerzitního základu. https://www.muni.cz/studenti/spolecny-univerzitni-zaklad

Jazyky

K úspěšnému ukončení studia na PřF má student povinnost absolvovat zkoušku JASUZ Odborná angličtina - zkouška za 4 kredity. Výuka jazyků je zajišťována Centrem jazykového vzdělávání MU.

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
PřF:JASUZOdborná angličtina - zkouška A. Bízková Doleželovázk 0/0/04 --
4 kredity
TV

Všichni studenti prezenčního studia bakalářských studijních programů mají povinnost během studia splnit podmínky pro udělení dvou zápočtů (1 zápočet = 1 kredit) z předmětů sportovních aktivit vypisovaných pod kódy P9. Předměty zajišťuje Centrum univerzitního sportu Fakulty sportovních studií.

Bakalářská práce (min 10kr.)

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
PřF:E5012Bakalářská práce z matematické biologie a biomedicíny I L. Dušekz 0/5/05 5Z
PřF:E5013Seminář k bakalářské práci z Matematické biologie a biomedicíny L. Dušekz 0/2/01 5Z
PřF:E6012Bakalářská práce z matematické biologie a biomedicíny II L. Dušekz 0/5/05 6Z
PřF:E6013Seminář k bakalářské práci z Matematické biologie a biomedicíny L. Dušekz 0/2/01 6Z
12 kreditů

Povinné předměty

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
PřF:Bi1700Buněčná biologie R. Veselskázk 2/0/02+2 1Z
PřF:Bi3060Obecná genetika P. Kuglíkzk 3/0/03+2 1Z
PřF:Bi4010Základy molekulární biologie J. Doškařzk 2/0/02+2 2Z
PřF:Bi6790Biologie živočichů M. Váchazk 2/0/02+2 4Z
PřF:C3580Biochemie P. Bouchalzk 3/0/03+2 3-
PřF:C7777Zacházení s chemickými látkami J. Literákz 0/0/0 2 hodiny školení autorizovanou osobou.- 1-
PřF:E1020Soft-skills I - Počítačová gramotnost P. Šebejz 0/1/01 1-
PřF:E1041Úvod do matematické biologie a biomedicíny I T. Pavlíkz 0/1/01 1-
PřF:E1051Úvod do matematické biologie a biomedicíny II T. Pavlíkz 1/0/01 2-
PřF:E2020Soft-skills II - Informační gramotnost P. Šebejz 0/1/01 2-
PřF:E3011Algoritmizace a programování D. Schwarzk 2/2/04+1 2P
PřF:E3020Soft-skills III - Vědecké myšlení P. Šebejz 0/1/01 3-
PřF:E4020Soft-skills IV - Prezentační dovednosti J. Uríkz 0/1/01 4-
PřF:E5046Biostatistika pro matematickou biologii a biomedicínu T. Pavlíkzk 2/1/03+2 3P
PřF:E6090Bakalářská státní závěrečná zkouška z Matematické biologie a biomedicíny L. Dušek- 0/0/0- 6Z
PřF:E7491Regresní modelování T. Pavlíkzk 2/13+2 5P
PřF:E8600Vícerozměrné metody J. Jarkovskýzk 2/1/03+2 4P
PřF:E8600cVícerozměrné metody - cvičení J. Jarkovskýz 0/1/01 4-
PřF:M1101Matematická analýza I P. Hasilzk 4/2/06+3 1Z
PřF:M1111Lineární algebra a geometrie I M. Čadekzk 2/2/04+2 1Z
PřF:M2100Matematická analýza II R. Šimon Hilscherzk 4/2/06+3 2Z
PřF:M2110Lineární algebra a geometrie II M. Čadekzk 2/2/04+2 2Z
PřF:M3121Pravděpodobnost a statistika I J. Koláčekzk 2/2/04+2 3Z
PřF:M4122Pravděpodobnost a statistika II J. Koláčekzk 2/2/04+2 4Z
91 kreditů

Volitelné předměty

Student si vybírá z volitelných předmětů na MU až do celkové výše 180 kreditů za studium. Je doporučeno vybírat ze 13 doporučovaných předmětů, které nejlépe odpovídají potřebám studia. Níže uvedený předmět slouží jako osvědčený příklad.

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
PřF:Bi3060cObecná genetika - cvičení P. Lízalz 0/2/02 1-
2 kredity

Specializační část

Povinné předměty

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
PřF:Bi6170Genetika II J. Řepkovázk 2/0/02+2 5P
PřF:Bi6270Cytogenetika a cytogenomika P. Kuglíkzk 2/0/02+2 6P
PřF:Bi6400Metody molekulární biologie R. Pantůčekzk 3/0/03+2 4P
PřF:Bi7090Molekulární biologie eukaryot J. Šmardazk 2/0/02+2 5P
PřF:C2110Operační systém UNIX a základy programování P. Kulhánekk 0/2/02+1 1-
PřF:C2131Úvod do bioinformatiky M. Wimmerovázk 2/0/02+2 2P
PřF:C2132Úvod do bioinformatiky - seminář M. Wimmerováz 0/1/01 2-
PřF:C2135Bioinformatika v praxi L. Malinovskák 0/2/02+1 4P
PřF:C2142Návrh algoritmů pro přírodovědce T. Račekzk 1/2/03+2 4P
PřF:C2184Úvod do programování v Pythonu T. Račekk 0/2/02+1 3-
PřF:E4013Týmový projekt z Matematické biologie a biomedicíny – biomedicínská bioinformatika L. Dušekz 0/2/02 3-
PřF:E7490Pokročilé neparametrické metody L. Dušekzk 1/1/03+2 6-
PřF:E7492Analýza sekvencí DNA N. Martínkovázk 2/1/03+2 5P
PřF:E7527Analýza dat v R E. Budinskák 2/0/02+1 3-
PřF:M4180Numerické metody I J. Zelinkazk 2/2/04+2 6-
PřF:M5444Markovské řetězce M. Budíkovázk 2/1/03+2 5-
62 kreditů