PřF BINFO Bioinformatika
Název anglicky: Bioinformatics
navazující prezenční se specializací, vyučovací jazyk: čeština
Zahrnut v programu: PřF N-BIC Biochemie
navazující prezenční se specializací, vyučovací jazyk: čeština
Zahrnut v programu: PřF N-BIC Biochemie
Informace o studiu
- Součásti SZZ a jejich obsahSoučástí SZZ jsou předměty Pokročilá biochemie a její metody (pro specializaci Bioinformatika), Bioinformatika a strukturní bioinformatika, Chemoiformatika a molekulové modelování, se zaměřením na širší teoretický základ studenta v oblastech biochemie, bioinformatiky a chemoinformatiky. Další součástí SZZ je Diplomová práce z biochemie, která je zaměřena na bioinformatické dovednosti studenta a na jeho schopnosti zpracovávat informace získané v rámci teoretické výuky. SZZ navazuje na následující profilující předměty:
C6215 Pokročilá biochemie a její metody
C7010 Oborový seminář z biochemie I
C8010 Oborový seminář z biochemie II
C9002 Oborový seminář z biochemie III
CA010 Oborový seminář z biochemie IV
C2136 Pokročilá chemoinformatika
C2137 Pokročilá chemoinformatika - seminář
C2138 Pokročilá bioinformatika
C2139 Pokročilá bioinformatika - seminář
C7790 Úvod do molekulového modelování
C3211 Aplikovaná bioinformatika
C8855 Pokročilé metody molekulového modelování
C8210 Diplomová práce II (BC)
C9300 Diplomová práce I (BC)
C9310 Diplomová práce III (BC)
CA340 Diplomová práce IV (BC)
Doporučený průchod studijním plánem
Společná část (60-80 kr.)
Diplomová práce (min 20kr.)
Povinné předměty
Každý akademický rok studia je nutno absolvovat povinný předmět bez kreditového hodnocení C7777 Zacházení s chemickými látkami zakončený zápočtem. Absolvování předmětu C7777 je nutnou podmínkou pro vstup do všech předmětů, ve kterých dochází k manipulaci s chemickými látkami, tzn. laboratorní cvičení, diplomová práce apod.
Kód | Název | Ukončení | Kreditů | Semestr | Profilace |
PřF:C6215 | Pokročilá biochemie a její metody | zk | 4 | 1 | P |
PřF:C7010 | Oborový seminář z biochemie I | z | 2 | 1 | P |
PřF:C8010 | Oborový seminář z biochemie II | z | 2 | 2 | P |
PřF:C9002 | Oborový seminář z biochemie III | z | 2 | 3 | P |
PřF:CA010 | Oborový seminář z biochemie IV | z | 2 | 4 | P |
PřF:JA002 | Pokročilá odborná angličtina - zkouška | zk | 2 | 4 | - |
14 kreditů |
Povinně-volitelné předměty
Volitelné předměty
Student si zapisuje předměty tak, aby za celé studium získal alespoň 120 kreditů.
Specializační část (40-60 kr.)
Povinné předměty
Kód | Název | Ukončení | Kreditů | Semestr | Profilace |
PřF:C2136 | Advanced chemoinformatics and drug design | zk | 2+2 | 1 | Z |
PřF:C2137 | Advanced chemoinformatics and drug design - seminar | z | 1 | 1 | P |
PřF:C2138 | Pokročilá bioinformatika | zk | 2+2 | 2 | Z |
PřF:C2139 | Pokročilá bioinformatika - seminář | z | 1 | 2 | P |
PřF:C7790 | Úvod do molekulového modelování | zk | 2+2 | 3 | P |
PřF:CZMCI | Státní závěrečná magisterská zkouška z bioinformatiky | SZk | - | 4 | - |
14 kreditů |
Povinně-volitelné předměty
Student je povinen z výběru povinně volitelných předmětů získat minimálně 26 kreditů.
Kód | Název | Ukončení | Kreditů | Semestr | Profilace |
PřF:Bi7820 | Genetika populací | zk | 2+2 | 2 | P |
PřF:Bi9680en | Artificial Intelligence in Biology, Chemistry, and Bioengineering | zk | 2+2 | 1 | P |
PřF:C3211 | Aplikovaná bioinformatika | k | 3 | 4 | P |
PřF:C7175 | DNA diagnostika | zk | 4 | 2 | P |
PřF:C7800 | Úvod do molekulového modelování - cvičení | z | 1 | 3 | P |
PřF:C7920 | Struktura a funkce proteinů | zk | 2+2 | 1 | P |
PřF:C7925 | Struktura a dynamika nukleových kyselin | zk | 2+2 | 1 | P |
PřF:C8855 | Pokročilé metody molekulového modelování | k | 1+1 | 4 | P |
PřF:C8863 | Výpočty volných energií | zk | 2+1 | 2 | P |
PřF:C9540 | Applied Computational Quantum Chemistry | k | 4+1 | 3 | P |
PřF:CG010 | Proteomika | zk | 2+2 | 3 | P |
PřF:CG020 | Genomika | zk | 2+2 | 3 | P |
PřF:E2011 | Teoretické základy informatiky | zk | 3+2 | 3 | P |
PřF:E5444 | Analysis of sequencing data | zk | 2+2 | 3 | P |
PřF:E7491 | Regresní modelování | zk | 3+2 | 2 | P |
PřF:E7527 | Analýza dat v R | k | 2+1 | 3 | P |
FI:PB112 | Základy objektově orientovaného programování v jazyce Java | zk | 3+2 | 2 | P |
64 kreditů |